15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1009 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1053    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1915  hypothetical protein  29.93 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1378  hypothetical protein  36.81 
 
 		 426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2528  hypothetical protein  23.46 
 
 		 526 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0136  hypothetical protein  23.21 
 
 		 524 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  22.78 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1836  hypothetical protein  22.22 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  25.87 
 
 		 545 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3209  hypothetical protein  26.87 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  23.03 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  22.55 
 
 		 542 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  23.97 
 
 		 547 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5583  hypothetical protein  30.39 
 
 		 494 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  23.67 
 
 		 639 aa  47  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1225  hypothetical protein  27.01 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>