20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1072 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1115    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  65.32 
 
 
545 aa  727    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  95.94 
 
 
542 aa  1070    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  23.82 
 
 
454 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  24.15 
 
 
547 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1836  hypothetical protein  21.95 
 
 
514 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1915  hypothetical protein  23.04 
 
 
527 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20500  hypothetical protein  25.5 
 
 
467 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49751  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2528  hypothetical protein  25.38 
 
 
526 aa  60.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3206  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.453952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0136  hypothetical protein  24.51 
 
 
524 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1378  hypothetical protein  27.96 
 
 
426 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  20.82 
 
 
639 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1194  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.18 
 
 
546 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1009  hypothetical protein  22.82 
 
 
536 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  21.07 
 
 
710 aa  50.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  25.25 
 
 
727 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1805  hypothetical protein  23.82 
 
 
759 aa  47  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  24.24 
 
 
724 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  28 
 
 
494 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>