10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20500  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  945    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1225  hypothetical protein  30.89 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  28.17 
 
 		 545 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  25.5 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  24.7 
 
 		 542 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  23.74 
 
 		 639 aa  60.1  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  27.57 
 
 		 724 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  23.77 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  26.97 
 
 		 727 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1317  CRISPR-associated protein, Crm2 family  41.18 
 
 		 650 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>