19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1861 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  65.32 
 
 		 542 aa  727    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  64.59 
 
 		 542 aa  717    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1115    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1009  hypothetical protein  25.46 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  20 
 
 		 454 aa  67  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1836  hypothetical protein  23.89 
 
 		 514 aa  67  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  24.55 
 
 		 547 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20500  hypothetical protein  28.17 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1915  hypothetical protein  23.7 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  25.72 
 
 		 727 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1805  hypothetical protein  24.53 
 
 		 759 aa  54.3  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0136  hypothetical protein  21.75 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  24.92 
 
 		 724 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1378  hypothetical protein  24.73 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  23.25 
 
 		 710 aa  51.2  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2528  hypothetical protein  26.79 
 
 		 526 aa  50.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3206  hypothetical protein  30.38 
 
 		 125 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.453952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  23.45 
 
 		 639 aa  47.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0316  CRISPR-associated protein, Crm2 family  22.75 
 
 		 548 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.182847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>