35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1823 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  100 
 
 		 607 aa  1242    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0700  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  41.68 
 
 		 616 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00738894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0579  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  31.33 
 
 		 628 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0964  CRISPR-associated Cmr2 family protein  33.1 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.662431  normal  0.765777 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2297  CRISPR-associated protein, Crm2 family  31.62 
 
 		 616 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2692  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  32.76 
 
 		 612 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  41.47 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  40.15 
 
 		 494 aa  159  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0263  CRISPR-associated Cmr2 family protein  28.85 
 
 		 629 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0649  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  28.08 
 
 		 638 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2979  CRISPR-associated protein, Crm2 family  27.55 
 
 		 623 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15150  CRISPR-associated protein, Crm2 family  25.8 
 
 		 676 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1791  CRISPR-associated protein, Crm2 family  27.51 
 
 		 637 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.175791  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0658  CRISPR-associated protein, Crm2 family  25.7 
 
 		 569 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1317  CRISPR-associated protein, Crm2 family  27.31 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1951  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.76 
 
 		 624 aa  107  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1026  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  35.75 
 
 		 812 aa  93.6  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1578  CRISPR-associated Cmr2 family protein  26.52 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0316  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.74 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.182847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1194  CRISPR-associated protein, Crm2 family  32.18 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0627  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  25.65 
 
 		 977 aa  69.3  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.397763  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0106  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  31.21 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1658  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  33.12 
 
 		 731 aa  67.8  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 		 735 aa  63.9  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  30 
 
 		 717 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  27.85 
 
 		 639 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 487 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_002950  PG1987  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.15 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0272  CRISPR-associated Cmr2 family protein  24.37 
 
 		 935 aa  47  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.35 
 
 		 757 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5328  hypothetical protein  26.8 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.213692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  28.95 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  28.67 
 
 		 492 aa  45.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  26.49 
 
 		 724 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  27.5 
 
 		 485 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>