36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1097 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  97.11 
 
 		 717 aa  1433    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 735 aa  1500    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  29.22 
 
 		 757 aa  274  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.53 
 
 		 808 aa  254  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  27.41 
 
 		 812 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.58 
 
 		 800 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 		 830 aa  185  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 		 757 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 		 799 aa  180  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.48 
 
 		 838 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  22.54 
 
 		 806 aa  161  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  23.41 
 
 		 808 aa  157  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.75 
 
 		 780 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.27 
 
 		 755 aa  147  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.85 
 
 		 845 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.86 
 
 		 731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 		 837 aa  125  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.7 
 
 		 848 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.64 
 
 		 850 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.1 
 
 		 719 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  22.74 
 
 		 810 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  29.74 
 
 		 737 aa  88.2  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  31.36 
 
 		 761 aa  87.4  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  31.25 
 
 		 750 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  46.67 
 
 		 762 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  22.31 
 
 		 755 aa  67.8  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  26.55 
 
 		 494 aa  62  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  31.48 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0316  CRISPR-associated protein, Crm2 family  30.92 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.182847  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0658  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.89 
 
 		 569 aa  56.2  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1194  CRISPR-associated protein, Crm2 family  33.09 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  26.87 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2297  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.62 
 
 		 616 aa  48.5  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2979  CRISPR-associated protein, Crm2 family  27.78 
 
 		 623 aa  47.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113889 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1026  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  26.01 
 
 		 812 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1290  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 914 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>