28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2826 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  100 
 
 		 737 aa  1479    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.36 
 
 		 755 aa  190  9e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.08 
 
 		 800 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.6 
 
 		 850 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.24 
 
 		 780 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.89 
 
 		 808 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.13 
 
 		 717 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  22.71 
 
 		 757 aa  138  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  28.68 
 
 		 806 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  29.46 
 
 		 719 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  21.26 
 
 		 837 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  24.16 
 
 		 799 aa  130  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.78 
 
 		 731 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.36 
 
 		 838 aa  122  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  30.05 
 
 		 808 aa  122  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  24.78 
 
 		 830 aa  113  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  36.32 
 
 		 845 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  40.27 
 
 		 848 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.47 
 
 		 810 aa  109  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  20.43 
 
 		 757 aa  105  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  35.68 
 
 		 812 aa  104  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 735 aa  92  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  31.6 
 
 		 750 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  31.44 
 
 		 762 aa  71.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.85 
 
 		 761 aa  59.7  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1541  HD superfamily hydrolase  26.9 
 
 		 1032 aa  54.3  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.980767  normal  0.454227 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  29.51 
 
 		 755 aa  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  27.18 
 
 		 494 aa  48.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>