26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2454 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  100 
 
 		 761 aa  1580    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  50.58 
 
 		 762 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  29.23 
 
 		 808 aa  178  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  25.33 
 
 		 812 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.3 
 
 		 731 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.71 
 
 		 719 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.6 
 
 		 717 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.11 
 
 		 850 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.23 
 
 		 845 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  38.01 
 
 		 800 aa  101  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  22.33 
 
 		 755 aa  100  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 		 837 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  22.65 
 
 		 848 aa  97.4  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 		 830 aa  94.4  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  24.95 
 
 		 799 aa  89  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  31.36 
 
 		 735 aa  87.4  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  31.87 
 
 		 750 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  22.66 
 
 		 810 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  34.9 
 
 		 757 aa  83.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  32.09 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 757 aa  75.1  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  34.06 
 
 		 780 aa  74.7  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  32.08 
 
 		 838 aa  67  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.96 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.85 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1361  hypothetical protein  30.1 
 
 		 919 aa  53.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.339781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>