34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1670 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 757 aa  1520    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  43.3 
 
 		 830 aa  612  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 		 837 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  28.42 
 
 		 731 aa  225  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.87 
 
 		 719 aa  213  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 799 aa  213  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.23 
 
 		 780 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.98 
 
 		 750 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.12 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.4 
 
 		 808 aa  187  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 		 735 aa  187  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.54 
 
 		 717 aa  180  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  30.28 
 
 		 757 aa  178  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.21 
 
 		 845 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  26.29 
 
 		 812 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.46 
 
 		 755 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  32.18 
 
 		 800 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.7 
 
 		 810 aa  135  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  22.99 
 
 		 808 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  21.99 
 
 		 806 aa  134  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  22.71 
 
 		 737 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.85 
 
 		 850 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.59 
 
 		 848 aa  99  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  28.21 
 
 		 762 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  28.68 
 
 		 761 aa  65.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1541  HD superfamily hydrolase  26.62 
 
 		 1032 aa  55.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.980767  normal  0.454227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 		 284 aa  51.2  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  21.77 
 
 		 755 aa  51.2  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 		 283 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 283 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 		 289 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1361  hypothetical protein  27.78 
 
 		 919 aa  47.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.339781  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1163  hypothetical protein  26.84 
 
 		 886 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00163358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  34.88 
 
 		 302 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>