33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12837 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  100 
 
 		 812 aa  1678    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  37.03 
 
 		 757 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  37.46 
 
 		 808 aa  492  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.12 
 
 		 717 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 		 735 aa  231  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  28.71 
 
 		 800 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.98 
 
 		 808 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  27.48 
 
 		 806 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.8 
 
 		 780 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.84 
 
 		 838 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 		 757 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.83 
 
 		 845 aa  156  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.18 
 
 		 761 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.36 
 
 		 731 aa  148  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 		 830 aa  147  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  23.36 
 
 		 755 aa  140  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  22.82 
 
 		 837 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  21.88 
 
 		 799 aa  132  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.27 
 
 		 750 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.54 
 
 		 848 aa  104  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.61 
 
 		 850 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  38.14 
 
 		 762 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  35.68 
 
 		 737 aa  95.1  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  29.67 
 
 		 719 aa  85.1  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.93 
 
 		 810 aa  68.2  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1541  HD superfamily hydrolase  27.17 
 
 		 1032 aa  57.8  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.980767  normal  0.454227 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.93 
 
 		 755 aa  53.9  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  34.04 
 
 		 488 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1951  CRISPR-associated protein, Crm2 family  28.3 
 
 		 624 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  29.94 
 
 		 494 aa  48.5  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1026  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  20.57 
 
 		 812 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1361  hypothetical protein  29.13 
 
 		 919 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.339781  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0964  CRISPR-associated Cmr2 family protein  32.89 
 
 		 477 aa  45.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.662431  normal  0.765777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>