25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1083 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  100 
 
 		 838 aa  1664    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  29.87 
 
 		 850 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.36 
 
 		 800 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 799 aa  211  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 		 837 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 		 757 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 		 830 aa  196  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  30.09 
 
 		 780 aa  195  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.71 
 
 		 755 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  26.84 
 
 		 812 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.31 
 
 		 717 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.39 
 
 		 845 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 		 735 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.23 
 
 		 808 aa  173  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.61 
 
 		 731 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.32 
 
 		 757 aa  167  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.43 
 
 		 848 aa  157  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  22.6 
 
 		 806 aa  140  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  21.31 
 
 		 808 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  43.93 
 
 		 750 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  23.63 
 
 		 737 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  21.12 
 
 		 810 aa  107  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.54 
 
 		 719 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  28.09 
 
 		 761 aa  68.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  28.49 
 
 		 762 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>