28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0699 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  78.59 
 
 		 806 aa  1278    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  100 
 
 		 808 aa  1640    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.97 
 
 		 780 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.76 
 
 		 848 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.93 
 
 		 845 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  28.35 
 
 		 812 aa  207  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.88 
 
 		 800 aa  189  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.83 
 
 		 717 aa  177  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.36 
 
 		 755 aa  172  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  23.2 
 
 		 735 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.78 
 
 		 757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.97 
 
 		 808 aa  159  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.1 
 
 		 850 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  22.74 
 
 		 757 aa  138  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  23.69 
 
 		 799 aa  129  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.15 
 
 		 731 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  21.58 
 
 		 838 aa  125  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.4 
 
 		 810 aa  125  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 		 830 aa  121  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  30.05 
 
 		 737 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  22.89 
 
 		 762 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  22.28 
 
 		 837 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.41 
 
 		 750 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  30.89 
 
 		 719 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.24 
 
 		 755 aa  65.5  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.65 
 
 		 761 aa  63.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  27.47 
 
 		 494 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  25.84 
 
 		 488 aa  52.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>