253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1870 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1870  prophage LambdaSa2, DNA replication protein DnaC, putative  100 
 
 
273 aa  568  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  27.01 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  27.01 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  27.01 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  27.01 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2215  phage protein  28.76 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  26.58 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  31.72 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  31.72 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  24.41 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2598  phage protein  25.82 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  22.95 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  33.1 
 
 
283 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  29.56 
 
 
241 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  29.58 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  26.11 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  24.15 
 
 
299 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  24.15 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  31.13 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  23.67 
 
 
297 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  26.95 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  26.95 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  26.95 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  26.95 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  26.95 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  28.04 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  28.04 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  25.73 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  25.24 
 
 
345 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  25.73 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  30.77 
 
 
243 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  24.51 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  25.95 
 
 
280 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3083  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  28.05 
 
 
343 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  27.18 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0041  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2975  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2282  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5325  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443001 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5450  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.532201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2113  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  22.44 
 
 
268 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4316  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256962  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0085  IstB domain protein ATP-binding protein  27.27 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0613596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  24.54 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  25.73 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  29.8 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  26.67 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  26.67 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  26.67 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  22.53 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0319  IstB-like ATP-binding protein  26.86 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0788  IstB-like ATP-binding protein  26.86 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.867709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0900  IstB-like ATP-binding protein  26.86 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.704977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1203  IstB-like ATP-binding protein  26.86 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3715  IstB-like ATP-binding protein  26.86 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3913  IstB-like ATP-binding protein  26.86 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1108  IstB domain protein ATP-binding protein  24.71 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  24.72 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  26.67 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6518  IstB ATP binding domain-containing protein  26.11 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.105365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  22.22 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  26.45 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  25.41 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  26.67 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  30.56 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  30.56 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  30.56 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  31.25 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  27.41 
 
 
263 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  28.77 
 
 
250 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  34.51 
 
 
605 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  25.37 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  27.86 
 
 
245 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  22.7 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1831  ATPase  25.85 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00675411  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2071  IstB-like ATP-binding protein  28.08 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.941019  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  23.65 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  27.81 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  28.77 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  26.06 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  22.98 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3066  IstB domain protein ATP-binding protein  24.6 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1038  IstB domain protein ATP-binding protein  26.35 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  25.87 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  25.87 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  28.21 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  25.12 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  23.41 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3044  IstB-like ATP-binding protein  27.7 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3057  IstB-like ATP-binding protein  27.7 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3924  IstB-like ATP-binding protein  26.43 
 
 
287 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  27.89 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  22.12 
 
 
264 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  29.23 
 
 
348 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1326  IstB ATP binding domain-containing protein  26.35 
 
 
166 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4736  IstB ATP binding domain-containing protein  27.67 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>