More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1038 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1038  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3044  IstB-like ATP-binding protein  89.9 
 
 		 287 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3057  IstB-like ATP-binding protein  89.9 
 
 		 287 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0319  IstB-like ATP-binding protein  88.85 
 
 		 287 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3913  IstB-like ATP-binding protein  88.85 
 
 		 287 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0788  IstB-like ATP-binding protein  88.5 
 
 		 287 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.867709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1203  IstB-like ATP-binding protein  88.15 
 
 		 287 aa  534  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3924  IstB-like ATP-binding protein  88.5 
 
 		 287 aa  534  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0900  IstB-like ATP-binding protein  88.15 
 
 		 287 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.704977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3715  IstB-like ATP-binding protein  88.15 
 
 		 287 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1108  IstB domain protein ATP-binding protein  81.74 
 
 		 242 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6518  IstB ATP binding domain-containing protein  75.62 
 
 		 244 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.105365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2497  ATPase  76.85 
 
 		 217 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  64.73 
 
 		 242 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  64.73 
 
 		 242 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.938722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0909  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3391  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3052  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043848 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5399  IstB ATP binding domain-containing protein  63.9 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2254  IstB ATP binding domain-containing protein  63.9 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5131  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701045  normal  0.85319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4172  IstB ATP binding domain-containing protein  63.9 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4981  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0040  IstB domain protein ATP-binding protein  63.64 
 
 		 243 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0017  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0885  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1293  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5104  IstB ATP binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 242 aa  328  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0070  IstB domain protein ATP-binding protein  61.98 
 
 		 243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2865  IstB domain protein ATP-binding protein  60 
 
 		 247 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0985234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0432  IstB-like ATP-binding protein  65.15 
 
 		 242 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0234924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0849  IstB-like ATP-binding protein  65.15 
 
 		 242 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.152009  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2411  IstB domain protein ATP-binding protein  59.83 
 
 		 245 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.11316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2885  IstB domain protein ATP-binding protein  59.83 
 
 		 245 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.46368e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4065  IstB domain protein ATP-binding protein  59.83 
 
 		 245 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  58.26 
 
 		 245 aa  321  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1489  IstB domain protein ATP-binding protein  60.58 
 
 		 242 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3577  IstB domain protein ATP-binding protein  60.58 
 
 		 242 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2697  IstB ATP binding domain-containing protein  56.49 
 
 		 239 aa  285  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  51.47 
 
 		 277 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  51.47 
 
 		 277 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  54.31 
 
 		 245 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  55.47 
 
 		 265 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  55.47 
 
 		 265 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  50.55 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  50.55 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  55.46 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  55.46 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  55.46 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  55.46 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  55.46 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  55.46 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  55.46 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  55.06 
 
 		 265 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  84.25 
 
 		 356 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  55.08 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  53.44 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0484  IstB-like ATP-binding protein  49.04 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3364  IstB-like ATP-binding protein  49.04 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  48.28 
 
 		 261 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  48.28 
 
 		 261 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  53.02 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  53.02 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  49.81 
 
 		 275 aa  254  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  52.97 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  52.97 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  52.97 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  52.48 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  52.48 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  52.48 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  52.48 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3051  IstB ATP binding domain-containing protein  52.77 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2114  IstB domain protein ATP-binding protein  48.15 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  51.27 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  48.38 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  50.86 
 
 		 264 aa  245  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1638  IS21 family transposase  50.86 
 
 		 264 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3045  IS21 family transposase  50.86 
 
 		 264 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3402  IS21 family transposase  50.86 
 
 		 264 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0314  IstB domain protein ATP-binding protein  52.12 
 
 		 256 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.198752  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0674  IstB domain protein ATP-binding protein  52.12 
 
 		 256 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109995  hitchhiker  0.00130899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1594  IstB domain protein ATP-binding protein  52.12 
 
 		 256 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.366268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1721  IstB domain protein ATP-binding protein  52.12 
 
 		 256 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1677  IstB domain protein ATP-binding protein  52.12 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3164  IstB ATP binding domain-containing protein  48.96 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0418  IstB-like ATP-binding protein  51.07 
 
 		 255 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176117  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1250  IstB-like ATP-binding protein  51.07 
 
 		 255 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2842  IstB-like ATP-binding protein  84.48 
 
 		 168 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2721  IstB ATP binding domain-containing protein  70.73 
 
 		 140 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  45.16 
 
 		 252 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3373  IstB ATP binding domain-containing protein  91.57 
 
 		 85 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.748723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  45.16 
 
 		 252 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>