More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0900 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0788  IstB-like ATP-binding protein  99.65 
 
 
287 aa  591  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.867709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0900  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
287 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.704977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3715  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
287 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1203  IstB-like ATP-binding protein  99.3 
 
 
287 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0319  IstB-like ATP-binding protein  98.95 
 
 
287 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3913  IstB-like ATP-binding protein  98.95 
 
 
287 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3924  IstB-like ATP-binding protein  90.94 
 
 
287 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1038  IstB domain protein ATP-binding protein  88.15 
 
 
287 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3044  IstB-like ATP-binding protein  88.85 
 
 
287 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3057  IstB-like ATP-binding protein  88.85 
 
 
287 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1108  IstB domain protein ATP-binding protein  79.25 
 
 
242 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6518  IstB ATP binding domain-containing protein  73.44 
 
 
244 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.105365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2497  ATPase  75 
 
 
217 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  63.9 
 
 
242 aa  338  7e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  63.9 
 
 
242 aa  338  7e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5399  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 
242 aa  336  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2254  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 
242 aa  336  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4172  IstB ATP binding domain-containing protein  64.32 
 
 
242 aa  336  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5131  IstB ATP binding domain-containing protein  63.07 
 
 
242 aa  328  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701045  normal  0.85319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0909  IstB ATP binding domain-containing protein  63.07 
 
 
242 aa  328  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  63.07 
 
 
242 aa  328  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3052  IstB ATP binding domain-containing protein  63.07 
 
 
242 aa  328  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  63.07 
 
 
242 aa  328  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.938722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3391  IstB ATP binding domain-containing protein  63.07 
 
 
242 aa  328  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4981  IstB ATP binding domain-containing protein  63.07 
 
 
242 aa  328  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0017  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0885  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1293  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  61.16 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5104  IstB ATP binding domain-containing protein  63.07 
 
 
242 aa  323  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0040  IstB domain protein ATP-binding protein  61.98 
 
 
243 aa  322  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2865  IstB domain protein ATP-binding protein  58.02 
 
 
247 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0985234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0432  IstB-like ATP-binding protein  63.07 
 
 
242 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0234924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0849  IstB-like ATP-binding protein  63.07 
 
 
242 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.152009  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  58.16 
 
 
245 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4065  IstB domain protein ATP-binding protein  58.16 
 
 
245 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2885  IstB domain protein ATP-binding protein  58.16 
 
 
245 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.46368e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2411  IstB domain protein ATP-binding protein  58.16 
 
 
245 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.11316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0070  IstB domain protein ATP-binding protein  59.5 
 
 
243 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166344  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1489  IstB domain protein ATP-binding protein  59.75 
 
 
242 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3577  IstB domain protein ATP-binding protein  59.75 
 
 
242 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  93.84 
 
 
356 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2697  IstB ATP binding domain-containing protein  56.07 
 
 
239 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.689881 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  54.31 
 
 
245 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  50.92 
 
 
269 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  50.92 
 
 
269 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  53.53 
 
 
265 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  53.53 
 
 
265 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  53.53 
 
 
265 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  53.53 
 
 
265 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  53.53 
 
 
265 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  53.53 
 
 
265 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  53.53 
 
 
265 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  51.31 
 
 
277 aa  269  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  51.31 
 
 
277 aa  269  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  51.88 
 
 
265 aa  266  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  54.25 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  54.25 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  54.24 
 
 
267 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  49.04 
 
 
261 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  49.04 
 
 
261 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0484  IstB-like ATP-binding protein  48.66 
 
 
261 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3364  IstB-like ATP-binding protein  48.66 
 
 
261 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  53.72 
 
 
253 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  51.39 
 
 
275 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
259 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
259 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  49.19 
 
 
260 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  49.19 
 
 
261 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
259 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3051  IstB ATP binding domain-containing protein  50.81 
 
 
266 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2114  IstB domain protein ATP-binding protein  53.25 
 
 
269 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 
273 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 
273 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 
273 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  52.07 
 
 
273 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  48.61 
 
 
268 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  50.6 
 
 
277 aa  245  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3045  IS21 family transposase  50.86 
 
 
264 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3402  IS21 family transposase  50.86 
 
 
264 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1638  IS21 family transposase  50.86 
 
 
264 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  50.86 
 
 
264 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0314  IstB domain protein ATP-binding protein  49.2 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.198752  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1721  IstB domain protein ATP-binding protein  49.2 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0674  IstB domain protein ATP-binding protein  49.2 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109995  hitchhiker  0.00130899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1594  IstB domain protein ATP-binding protein  49.2 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.366268  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1677  IstB domain protein ATP-binding protein  49.2 
 
 
256 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3164  IstB ATP binding domain-containing protein  47.95 
 
 
260 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0418  IstB-like ATP-binding protein  49.79 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176117  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1250  IstB-like ATP-binding protein  49.79 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2842  IstB-like ATP-binding protein  93.1 
 
 
168 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2721  IstB ATP binding domain-containing protein  69.92 
 
 
140 aa  195  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844746 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3373  IstB ATP binding domain-containing protein  89.16 
 
 
85 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.748723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  36.91 
 
 
252 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  36.91 
 
 
252 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>