110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2792 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2792  TenA family transcription regulator  100 
 
 
213 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.810645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0096  transcriptional activator, TenA family  55.88 
 
 
198 aa  211  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1517  TenA family transcription regulator  47.94 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.368689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0300  TenA family transcription regulator  37.86 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2909  transcriptional activator, TenA family  38.73 
 
 
208 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0826  transcriptional activator, TenA family  35.92 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.113488  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5033  TenA family transcription regulator  33.97 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843073  normal  0.0290758 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02220  expressed protein  27.12 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2986  transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  27.05 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  26.27 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  26.27 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  26.27 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  26.27 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  26.27 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  26.27 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  26.51 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  31.31 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  25.81 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  25.35 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  26.87 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  26.29 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  25.58 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02853  transcription regulator PAB1642, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11955)  27.8 
 
 
257 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00773039  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  26.24 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  25 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  31.25 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  33.51 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  26.54 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  29.05 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0123  putative transcriptional activator, TenA family  33.51 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  27.05 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  29.29 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  28.12 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  24.62 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  28.24 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  26.05 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  26.06 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  28.37 
 
 
221 aa  54.7  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  24.5 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  30.81 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  24.5 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  22.94 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  26 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  24.5 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  26.44 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  30.7 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  25 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  24.5 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  25 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  24.5 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0805  TenA family transcription regulator  28.42 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  33.93 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  24 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  24 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  28.57 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  24 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0858  TENA/THI-4 protein  30.28 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  32.34 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  24.5 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  20.38 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3429  TenA family transcription regulator  29.76 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.549237 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  27.8 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  27.64 
 
 
494 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  25.84 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  29.81 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3694  putative transcription activator  29.27 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  27.52 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  27.18 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  26.67 
 
 
232 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3673  TenA family transcription regulator  29.7 
 
 
213 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174709  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1094  TenA family transcriptional activator  28.5 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331158  hitchhiker  0.000493191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  28.37 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1950  transcriptional regulator  23.04 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  26.83 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  27.88 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  25.84 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  23 
 
 
227 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  31.48 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  26.15 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  22.52 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  39.53 
 
 
561 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  32.11 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  22.52 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  27.62 
 
 
243 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  31.92 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  32.08 
 
 
219 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  18.87 
 
 
222 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2953  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03941  TENA/THI-4 protein  25.79 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.511301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  29.86 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  22.07 
 
 
222 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  31.46 
 
 
219 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  24.84 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1301  TenA family transcriptional activator  26.4 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  0.976947 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0495  TenA family transcription regulator  23.5 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  25 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  26.4 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4454  TENA/THI-4 domain-containing protein  28.29 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.592634 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  33.8 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.23459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>