133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2677 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  90.87 
 
 		 221 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  90.41 
 
 		 219 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  90.83 
 
 		 219 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0858  TENA/THI-4 protein  76.5 
 
 		 220 aa  345  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  61.68 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  57.67 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2374  transcriptional activator  45 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  44.44 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3122  TenA family transcription regulator  49.53 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  45.45 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  44.65 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  44.44 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  44.09 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  43.52 
 
 		 234 aa  173  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1209  TenA family transcription regulator  42.06 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  44.55 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  43.87 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  43.07 
 
 		 510 aa  158  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  42.2 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  37.68 
 
 		 561 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  34.72 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  33.94 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  34.26 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  35.94 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  30.73 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  34.58 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  38.94 
 
 		 231 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  32.71 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  32.71 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  32.71 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  32.71 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  32.71 
 
 		 231 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  32.71 
 
 		 231 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  32.71 
 
 		 231 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  33.49 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  31.78 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  33.5 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  35.05 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  31.31 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  30.52 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  30.41 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  29.59 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  27.06 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  29 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  33.01 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  30.2 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  30.7 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70077  Phosphomethylpyrimidine kinase THI21 (HMP-phosphate kinase) (HMP-P kinase)  28.45 
 
 		 583 aa  94.4  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.583202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  32.08 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  30.91 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  36.14 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  30.41 
 
 		 212 aa  91.7  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  29.44 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  30.61 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  32.42 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  29.9 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03941  TENA/THI-4 protein  28.35 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.511301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  27.91 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  28.37 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88734  predicted protein  33.67 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.6901  normal  0.220592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  28.37 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  28.37 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  28.37 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  28.37 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  42 
 
 		 499 aa  86.3  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  28.37 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  27.91 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  28.37 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  30.14 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  27.91 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03931  TENA/THI-4 protein  27.84 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  26.98 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  29.03 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  32.08 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  32.05 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0805  TenA family transcription regulator  29.29 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  30.23 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  33.68 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  30.66 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0123  putative transcriptional activator, TenA family  31.87 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  36.84 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0025  transcriptional activator, TenA family  28.44 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  31.19 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  30.35 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  33.95 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  34.74 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10853  putative transcriptional activator (TenA family)  25 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  30.81 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  31.16 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  32.65 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  32.65 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  32.65 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  30.66 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  32.52 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  29.38 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1094  TenA family transcriptional activator  31.76 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331158  hitchhiker  0.000493191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0021  TenA family transcription regulator  28.41 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>