141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1028 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  100 
 
 
218 aa  454  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  87.1 
 
 
217 aa  394  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  53.49 
 
 
216 aa  247  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  51.63 
 
 
216 aa  228  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  50 
 
 
230 aa  205  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  46.3 
 
 
223 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  50.23 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4454  TENA/THI-4 domain-containing protein  50.69 
 
 
227 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.592634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4968  transcriptional activator, TenA family  49.77 
 
 
227 aa  187  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.0204405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  44.24 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  42.72 
 
 
224 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  44.24 
 
 
232 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  39.72 
 
 
220 aa  176  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  39.81 
 
 
229 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  39.81 
 
 
229 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  39.81 
 
 
229 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  43.26 
 
 
243 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  42.33 
 
 
232 aa  168  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  43.98 
 
 
219 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10853  putative transcriptional activator (TenA family)  40.2 
 
 
217 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  40.37 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2169  transcriptional activator, TenA family  35.35 
 
 
220 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  39.71 
 
 
226 aa  160  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  36.82 
 
 
222 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  39.27 
 
 
227 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  37.9 
 
 
221 aa  153  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  34.1 
 
 
221 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  36.99 
 
 
221 aa  148  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  36.24 
 
 
231 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  36.53 
 
 
232 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  32.58 
 
 
231 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  33.03 
 
 
231 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  37.61 
 
 
494 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  34.76 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  33.33 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0139  TenA family transcription regulator  34.48 
 
 
223 aa  132  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.743065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  32.88 
 
 
229 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  32.88 
 
 
229 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  33.33 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  32.42 
 
 
229 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  32.13 
 
 
231 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  32.13 
 
 
231 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  32.42 
 
 
229 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  32.13 
 
 
231 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  32.42 
 
 
229 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  32.13 
 
 
231 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  32.42 
 
 
229 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  32.13 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  33.33 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  32.13 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  32.13 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  33.33 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  32.42 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  31.67 
 
 
231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  32.13 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  31.96 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34896  predicted protein  32.88 
 
 
226 aa  125  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  31.94 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  37.44 
 
 
518 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  33.79 
 
 
236 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  33.48 
 
 
219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  33.8 
 
 
208 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  33.48 
 
 
219 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  35.32 
 
 
531 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  33.82 
 
 
205 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  32.88 
 
 
232 aa  114  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1950  transcriptional regulator  27.98 
 
 
218 aa  113  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0140  TenA family transcription regulator  31.25 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.153556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  33.17 
 
 
518 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0021  TenA family transcription regulator  33.89 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  35.57 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  32.86 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  32.86 
 
 
212 aa  108  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  32.86 
 
 
212 aa  107  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  36.98 
 
 
203 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0805  TenA family transcription regulator  31.6 
 
 
213 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  31.94 
 
 
214 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  31.94 
 
 
231 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  32.7 
 
 
205 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0123  putative transcriptional activator, TenA family  33.49 
 
 
201 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  32.67 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 
499 aa  98.6  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  30.9 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  30.77 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  28.85 
 
 
231 aa  95.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1094  TenA family transcriptional activator  30.81 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331158  hitchhiker  0.000493191 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  29.86 
 
 
561 aa  94  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2953  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  30.26 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  31.02 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  34.74 
 
 
599 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  31.31 
 
 
236 aa  92.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  32.87 
 
 
232 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  29.41 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  28.5 
 
 
510 aa  89.4  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  28.11 
 
 
207 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0855  transcriptional activator, TenA family  35.16 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0441715  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  30.41 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  30.05 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  26.19 
 
 
222 aa  85.5  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>