128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0406 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  100 
 
 
234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1209  TenA family transcription regulator  51.17 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  48.15 
 
 
236 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2374  transcriptional activator  48.82 
 
 
226 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3122  TenA family transcription regulator  46.82 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  47.83 
 
 
220 aa  194  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  47.2 
 
 
232 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  47.34 
 
 
222 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  45.97 
 
 
220 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0858  TENA/THI-4 protein  45.02 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  44.19 
 
 
219 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  43.52 
 
 
221 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  43.98 
 
 
219 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  43.52 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  44.02 
 
 
510 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  43.78 
 
 
224 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  44.89 
 
 
232 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  43.72 
 
 
232 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  44.89 
 
 
232 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  44.44 
 
 
231 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  38.76 
 
 
561 aa  152  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  40.74 
 
 
225 aa  141  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  36.23 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  32.26 
 
 
222 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  32.26 
 
 
221 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  31.8 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  35.91 
 
 
231 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  33.49 
 
 
231 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  33.33 
 
 
221 aa  121  9e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  32.69 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  33.17 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  33.17 
 
 
231 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  33.17 
 
 
231 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  33.17 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  33.17 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  33.17 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  32.85 
 
 
231 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  33.01 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  32.69 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  32.87 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  31.86 
 
 
221 aa  112  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  24.53 
 
 
221 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  31.96 
 
 
223 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  31.66 
 
 
219 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  26.89 
 
 
222 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  29.38 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  29.38 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  37.65 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  33 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  29.38 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  29.38 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  29.38 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  28.71 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  29.38 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  29.38 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  28.28 
 
 
207 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  29.15 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  27.83 
 
 
229 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  29.58 
 
 
231 aa  91.7  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  27.96 
 
 
229 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  33.51 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  28.44 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  34.72 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  31.41 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  30.69 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  30.3 
 
 
207 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03941  TENA/THI-4 protein  30.3 
 
 
207 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.511301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  29.63 
 
 
232 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  28.5 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  29.91 
 
 
212 aa  87  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  30.05 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  29.56 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03931  TENA/THI-4 protein  29.29 
 
 
207 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0805  TenA family transcription regulator  29.65 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  29.44 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  30.1 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  27.14 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  30.32 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10853  putative transcriptional activator (TenA family)  26.98 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  28.71 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  28.17 
 
 
227 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  28.57 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  31.4 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  31.4 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  31.4 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  33.95 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  27.55 
 
 
232 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  28.71 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  31.21 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  26.48 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0021  TenA family transcription regulator  29.85 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  29.14 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70077  Phosphomethylpyrimidine kinase THI21 (HMP-phosphate kinase) (HMP-P kinase)  30.23 
 
 
583 aa  75.5  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.583202  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1094  TenA family transcriptional activator  29.48 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331158  hitchhiker  0.000493191 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88734  predicted protein  30.86 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.6901  normal  0.220592 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  30.88 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  27.98 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  32.85 
 
 
499 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  32.52 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  29.17 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>