131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3656 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  64.71 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  58.9 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  52.19 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  53.24 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  52.78 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  48.44 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  44.5 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0858  TENA/THI-4 protein  44.75 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2374  transcriptional activator  43.54 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  42.2 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3122  TenA family transcription regulator  46.82 
 
 		 226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  42.2 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  41.9 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  42.34 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  41.28 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  40.83 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  40.74 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  38.03 
 
 		 561 aa  152  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  35.91 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  38.36 
 
 		 510 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  35.87 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  35.45 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1209  TenA family transcription regulator  37.5 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  33.95 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  30.19 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  31.1 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  31.1 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  31.1 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  31.1 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  31.1 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  31.1 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  31.1 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  30.62 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  30.62 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  30.14 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  33.64 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  33.65 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  31.51 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  34.13 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  31.55 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  33.02 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  33.94 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  33.49 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  33.94 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  33.94 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  33.94 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  33.49 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  33.94 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  32.37 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  32.56 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  27.36 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  32.11 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  32.57 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  32.57 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  31.13 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  32.57 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  27.19 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  26.76 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  28.1 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  32.3 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  31.28 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  30.67 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  30.48 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  32.75 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  32.75 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  32.75 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  33.92 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  27.89 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  32.56 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  32.82 
 
 		 205 aa  85.1  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  29.59 
 
 		 221 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  26.29 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  29.11 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  28.72 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  29.21 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  27.36 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  26.89 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  31.37 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  33.14 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70077  Phosphomethylpyrimidine kinase THI21 (HMP-phosphate kinase) (HMP-P kinase)  27.06 
 
 		 583 aa  81.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.583202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  32.47 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88734  predicted protein  29.26 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.6901  normal  0.220592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0805  TenA family transcription regulator  31.79 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1950  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03941  TENA/THI-4 protein  30.12 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.511301  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  32.99 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  27.83 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03931  TENA/THI-4 protein  30.12 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  29.56 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10853  putative transcriptional activator (TenA family)  27.48 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  30.2 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  29.65 
 
 		 518 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2953  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  30.26 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0021  TenA family transcription regulator  28.96 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  29.85 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  28.99 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  27.23 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>