128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1950 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1950  transcriptional regulator  100 
 
 
218 aa  447  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  42.2 
 
 
227 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  42.66 
 
 
232 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  40.83 
 
 
227 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  39.91 
 
 
229 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  39.45 
 
 
229 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  39.91 
 
 
229 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  39.45 
 
 
229 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  39.45 
 
 
229 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  38.99 
 
 
228 aa  168  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  38.99 
 
 
229 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  38.99 
 
 
229 aa  168  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  38.99 
 
 
229 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  38.99 
 
 
229 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  35.5 
 
 
223 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  32.73 
 
 
231 aa  121  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  31.82 
 
 
231 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  31.82 
 
 
231 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  31.82 
 
 
231 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  31.82 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  31.82 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  31.82 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  31.08 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  31.82 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  31.82 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  31.36 
 
 
231 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  30.45 
 
 
222 aa  115  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  30.91 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  27.78 
 
 
229 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  27.78 
 
 
229 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  27.78 
 
 
229 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  30.49 
 
 
230 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  29.17 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  27.98 
 
 
218 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  28.51 
 
 
217 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  30.14 
 
 
222 aa  111  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  29.28 
 
 
216 aa  111  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  26.09 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  26.57 
 
 
243 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  30.05 
 
 
220 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  27.64 
 
 
232 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  27.19 
 
 
219 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  28.51 
 
 
219 aa  105  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  27.64 
 
 
232 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  35.29 
 
 
224 aa  104  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  26.26 
 
 
221 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0839  TenA family transcription regulator  27.52 
 
 
226 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.306624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  31.53 
 
 
494 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  29.44 
 
 
231 aa  101  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  28.64 
 
 
231 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  28.05 
 
 
221 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  26.7 
 
 
219 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  26.94 
 
 
228 aa  98.2  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  30.39 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2953  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  27.15 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4968  transcriptional activator, TenA family  29.15 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.0204405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10853  putative transcriptional activator (TenA family)  27.27 
 
 
217 aa  92  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  27.14 
 
 
227 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  27.8 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2169  transcriptional activator, TenA family  30.32 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4454  TENA/THI-4 domain-containing protein  27.14 
 
 
227 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.592634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  26.76 
 
 
518 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  29.44 
 
 
531 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3122  TenA family transcription regulator  27.44 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  28.29 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  25.45 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  27.51 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  27.51 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2131  TenA family transcription regulator  28.37 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00735431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2169  TENA/THI-4 domain-containing protein  28.37 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0930547  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34896  predicted protein  25.12 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  27.65 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  26.55 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  26.96 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  28.84 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_002978  WD0139  TenA family transcription regulator  26.26 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.743065  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  30.19 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  30.19 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0025  transcriptional activator, TenA family  30.15 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1701  TenA family transcription regulator  26.58 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  27.7 
 
 
499 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  24.76 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  26.07 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  26.27 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  27.36 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  26.37 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  27.78 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  24.53 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  27.15 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  25 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  26.7 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  27.23 
 
 
599 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  25.99 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  27.44 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  26.24 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  28.83 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  25 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  26.85 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  23.65 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>