86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1701 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1701  TenA family transcription regulator  100 
 
 		 229 aa  478  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2169  TENA/THI-4 domain-containing protein  62.45 
 
 		 229 aa  317  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0930547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2131  TenA family transcription regulator  62.45 
 
 		 229 aa  317  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00735431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0839  TenA family transcription regulator  37.09 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.306624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  28.38 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  28.89 
 
 		 234 aa  98.2  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  29.15 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  29.52 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  29.6 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  29.39 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  28.44 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2953  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  28 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  28.95 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  24.43 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  28.95 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  28.95 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  28 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  27.8 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  28.95 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  28 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  28 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  27.8 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  28.95 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  28 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  28.95 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  28 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  28 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  28.51 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  28.51 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  27.23 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  27.56 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  27.11 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  25.45 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1950  transcriptional regulator  26.58 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  23.35 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  25.11 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  26.24 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  23.77 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  23.21 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  23.21 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  23.21 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  22.17 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  26.82 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  23.08 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  22.67 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  22.58 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  25.11 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  23.5 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  26.7 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0805  TenA family transcription regulator  25.23 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  24.54 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  22.77 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  24.32 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  26.87 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  25.27 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  23.15 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0564389 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  23.66 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3122  TenA family transcription regulator  26.5 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  23.53 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10853  putative transcriptional activator (TenA family)  19.82 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  23.38 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  26.63 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  25.98 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  20.35 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  24.89 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2374  transcriptional activator  24.26 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  23.5 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  22.37 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  22.37 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  23.11 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  20.35 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  23.15 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  21.86 
 
 		 599 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  19.11 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  26.59 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  23.72 
 
 		 518 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2169  transcriptional activator, TenA family  21.92 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1094  TenA family transcriptional activator  23.39 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331158  hitchhiker  0.000493191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  22.97 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  23.88 
 
 		 518 aa  42.4  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  23.78 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  21.93 
 
 		 234 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  20.91 
 
 		 228 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  24 
 
 		 494 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>