75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5033 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5033  TenA family transcription regulator  100 
 
 
207 aa  427  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843073  normal  0.0290758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0096  transcriptional activator, TenA family  34.84 
 
 
198 aa  85.9  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2792  TenA family transcription regulator  33.99 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.810645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1517  TenA family transcription regulator  30.57 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.368689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2909  transcriptional activator, TenA family  27.1 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  25 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  24.62 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02853  transcription regulator PAB1642, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11955)  25.76 
 
 
257 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00773039  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0300  TenA family transcription regulator  23.27 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  33.62 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  22.15 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  23.94 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0123  putative transcriptional activator, TenA family  29.94 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0495  TenA family transcription regulator  31.97 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  23 
 
 
217 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  21.52 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  21.52 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  21.52 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  21.52 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  21.52 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  21.52 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  25 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  21.52 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  31.03 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  20.72 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  20.25 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  20.89 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  24.29 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0826  transcriptional activator, TenA family  26.9 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.113488  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  23.83 
 
 
221 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  23.68 
 
 
205 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  23.81 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  25.89 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  20.53 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  24.27 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  21.84 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  21.84 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  21.84 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  21.67 
 
 
227 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  22.51 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  25 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45181  predicted protein  38.6 
 
 
183 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4968  transcriptional activator, TenA family  25 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.0204405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  25 
 
 
232 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03941  TENA/THI-4 protein  21.62 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.511301  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  25.96 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3673  TenA family transcription regulator  25.91 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174709  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  24.4 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  26.19 
 
 
234 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  21.95 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  21.95 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03931  TENA/THI-4 protein  20.54 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  23.9 
 
 
222 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  24.4 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  20 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  22.12 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  25.32 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  22.36 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  25.81 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4454  TENA/THI-4 domain-containing protein  24.84 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.592634 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  19.62 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  23.56 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  20.34 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  20.34 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  20.34 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  20.34 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  26.02 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  23.08 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  20.34 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  20.34 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  21.23 
 
 
221 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  20.34 
 
 
229 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  20.34 
 
 
229 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  20.34 
 
 
229 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  20.34 
 
 
229 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>