37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0096 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0096  transcriptional activator, TenA family  100 
 
 		 198 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1517  TenA family transcription regulator  60.87 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2792  TenA family transcription regulator  55.88 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.810645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2909  transcriptional activator, TenA family  36.27 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0300  TenA family transcription regulator  34.8 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0826  transcriptional activator, TenA family  34.17 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.113488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5033  TenA family transcription regulator  34.84 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843073  normal  0.0290758 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02220  expressed protein  26.27 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0123  putative transcriptional activator, TenA family  33.51 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  33.16 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  34.88 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0495  TenA family transcription regulator  28.44 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  33.16 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3429  TenA family transcription regulator  29.63 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.549237 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43079  predicted protein  22.27 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766897  normal  0.0273535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0025  transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02853  transcription regulator PAB1642, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11955)  25 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00773039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3694  putative transcription activator  29.63 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2986  transcriptional activator, TenA family  31.25 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  48.84 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  24.84 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  32.63 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  29.38 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  29.86 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1209  TenA family transcription regulator  27.59 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3673  TenA family transcription regulator  30.89 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  27.45 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  26.42 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  24.71 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  28.39 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45181  predicted protein  23.85 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  35.42 
 
 		 229 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  30.06 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  23.11 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  35.42 
 
 		 229 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  35.42 
 
 		 229 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  43.14 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>