236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0582 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0582  aldo/keto reductase  100 
 
 		 297 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.86981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1244  aldo/keto reductase  41.79 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0202  oxidoreductase  32.98 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0672  aldo/keto reductase  34.13 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0091  hypothetical protein  30.41 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.402529  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3568  aldo/keto reductase  29.74 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.780861  normal  0.215858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0062  bifunctional regulator KidO  28.52 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.99559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  30.56 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1895  aldo/keto reductase  29.85 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  30 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  26.85 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  28 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  34.81 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  33.52 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  30.41 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  25.19 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  27.06 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  27.11 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  30.39 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  26.82 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.43 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  27.68 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  27.92 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05031  aldo/keto reductase  28.09 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  30.34 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  26.49 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  26.97 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  24.1 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3684  aldo/keto reductase  27.55 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  29.21 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  30.53 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  28.25 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0536  putative aldose reductase  27.01 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0284216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2308  aldo/keto reductase  32.17 
 
 		 373 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  27.92 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  33.54 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  30.99 
 
 		 335 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.207578 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09457  conserved hypothetical protein  31.28 
 
 		 486 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0221624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  25.99 
 
 		 331 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.63 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  24.38 
 
 		 319 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2905  aldo/keto reductase  35.71 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789445  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  26.97 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1410  aldo/keto reductase  30 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.14 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  25.86 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  28.38 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  26.88 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3785  Aldehyde reductase  28.5 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  26.24 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  31.29 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  31.29 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  25.12 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  26.09 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  29.52 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  24.52 
 
 		 379 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5178  aldo/keto reductase  28.89 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  30.15 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  30.81 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  31.85 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  29.52 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  28.89 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  25.51 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.55 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0175  aldo/keto reductase  31.61 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0823113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  27.4 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  25.21 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  26.84 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.33 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  25.43 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.33 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.33 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.33 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  26.56 
 
 		 344 aa  48.9  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.33 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  28.96 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  25.74 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0759  aldo/keto reductase  25.82 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  26.49 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  30.07 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  32.05 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  27.14 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  30.43 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  31.72 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  29.27 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  30.35 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  26.19 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  29.19 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1670  aldo/keto reductase  24.33 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5658  aldo/keto reductase  27.23 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.02 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  26.34 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  27.38 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  25.45 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.34 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0440  aldo/keto reductase  27.81 
 
 		 380 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>