37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0062 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0062  bifunctional regulator KidO  100 
 
 
291 aa  554  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.99559  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1244  aldo/keto reductase  32.29 
 
 
312 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0672  aldo/keto reductase  29.07 
 
 
285 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0582  aldo/keto reductase  28.52 
 
 
297 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.86981  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0202  oxidoreductase  26.88 
 
 
302 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0091  hypothetical protein  27.21 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.402529  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3568  aldo/keto reductase  24.09 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.780861  normal  0.215858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  27.42 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  29.27 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.64 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  27.72 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0759  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  31.73 
 
 
313 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  27.8 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1895  aldo/keto reductase  25.2 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  26.79 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  30.66 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  27.04 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  25.41 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  28.86 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  27.34 
 
 
285 aa  47  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  24.28 
 
 
272 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  27.34 
 
 
285 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  28.85 
 
 
270 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.15 
 
 
350 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3654  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  24.36 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  31.43 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
333 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  33.1 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  24.42 
 
 
305 aa  42.7  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1918  2,5-didehydrogluconate reductase  32.2 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3836  aldo/keto reductase  24.25 
 
 
331 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1556  aldo/keto reductase  42.19 
 
 
383 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4115  aldo/keto reductase  24.51 
 
 
315 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.905016 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  28.42 
 
 
379 aa  42.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  24.51 
 
 
319 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>