More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1410 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1410  aldo/keto reductase  100 
 
 
285 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  91.58 
 
 
285 aa  534  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  67.48 
 
 
286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0658  aldo/keto reductase  48.19 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1306  aldo/keto reductase  41.73 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  36.94 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  36.67 
 
 
294 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3300  aldo/keto reductase  36.67 
 
 
294 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  30.9 
 
 
283 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0104  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
294 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  29.89 
 
 
285 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  29.89 
 
 
285 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
370 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  39.26 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.92 
 
 
275 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  34.17 
 
 
294 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  36.9 
 
 
332 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  31.33 
 
 
340 aa  95.5  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  35 
 
 
369 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  40 
 
 
328 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  40 
 
 
328 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  34.86 
 
 
345 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  36.05 
 
 
341 aa  92.8  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
350 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1186  aldo/keto reductase  32.91 
 
 
393 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.472263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  36.97 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  32.88 
 
 
351 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  35.36 
 
 
386 aa  89  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  30.85 
 
 
343 aa  89  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0534  aldo/keto reductase  29.7 
 
 
282 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  33.53 
 
 
338 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  33.53 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  28.25 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0140  aldo/keto reductase  33.99 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0208468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  32.43 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  32.02 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  30.36 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  24.09 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  32.96 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  31.14 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  34.34 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  32.92 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  31.84 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  27.37 
 
 
431 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4535  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
394 aa  75.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0927734  decreased coverage  0.00892549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0202  aldo/keto reductase  32.45 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4324  aldo/keto reductase  31.97 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  29.31 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0206  aldo/keto reductase  32.45 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  32.22 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3604  aldo/keto reductase  28.5 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436577  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  28.7 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  29.72 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4912  aldo/keto reductase  31.13 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0730904  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  28.09 
 
 
397 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  26.21 
 
 
365 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.46 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  33.12 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  41.58 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  40.59 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  30.62 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1326  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.78 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  32.61 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0898  aldo/keto reductase  24.79 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  31.07 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  29.05 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  30.58 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  36.59 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  30.86 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  29.46 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  26.67 
 
 
376 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3138  aldo/keto reductase  30.46 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1747  hypothetical protein  30.97 
 
 
394 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482758  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  24.81 
 
 
376 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16661  aldo/keto reductase  26.97 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  27.59 
 
 
347 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  28.63 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2025  aldo/keto reductase  32.8 
 
 
334 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2266  aldo/keto reductase  32 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000706888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  37.84 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2056  hypothetical protein  31.87 
 
 
399 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0216146  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1569  aldo/keto reductase  25.93 
 
 
397 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  33.9 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  31.1 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3239  aldo/keto reductase  29.95 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  36.36 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16781  aldo/keto reductase  25.77 
 
 
397 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  34.3 
 
 
327 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2350  aldo/keto reductase  35.71 
 
 
350 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.788552  normal  0.04673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  31.55 
 
 
373 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  23.83 
 
 
374 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  36.44 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  32.02 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  30.9 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  34 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2110  aldo/keto reductase  27.13 
 
 
396 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.797322  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  27.92 
 
 
377 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>