More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2503 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  100 
 
 
374 aa  780    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  69.52 
 
 
376 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  40.89 
 
 
377 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  39.32 
 
 
377 aa  247  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  37.77 
 
 
376 aa  236  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  37.21 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  37.66 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  38.38 
 
 
376 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  37.47 
 
 
400 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  36.53 
 
 
383 aa  229  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  39.05 
 
 
371 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.27 
 
 
382 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  36.03 
 
 
384 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  36.39 
 
 
365 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  36.39 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  37.79 
 
 
409 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  36.76 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  37.31 
 
 
408 aa  219  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  38.3 
 
 
400 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  37.21 
 
 
409 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  35.94 
 
 
410 aa  216  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  36.8 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  34.93 
 
 
396 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  34.6 
 
 
399 aa  205  9e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  34.11 
 
 
380 aa  202  8e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  36.34 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  35.26 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  35.66 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  36.02 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  34.9 
 
 
374 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  33.76 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  32.35 
 
 
337 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  36.18 
 
 
397 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  30.87 
 
 
364 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  30 
 
 
386 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  30.18 
 
 
376 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  30.42 
 
 
376 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  29.02 
 
 
371 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  30.26 
 
 
374 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  31.81 
 
 
340 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  30.79 
 
 
374 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  28.42 
 
 
376 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  32.71 
 
 
375 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  31.54 
 
 
364 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  26.87 
 
 
383 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  30.73 
 
 
379 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  28.35 
 
 
370 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  30.83 
 
 
370 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1057  aldo/keto reductase  30.75 
 
 
374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.11 
 
 
350 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  28.76 
 
 
373 aa  143  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2587  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
368 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465282  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  26.92 
 
 
370 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1621  aldo/keto reductase  27.6 
 
 
380 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  28.03 
 
 
343 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0440  aldo/keto reductase  27.59 
 
 
380 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102195  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04651  aldo/keto reductase  27.32 
 
 
380 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.205889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  29.97 
 
 
332 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  32.6 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  32.6 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05031  aldo/keto reductase  26.98 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  32.29 
 
 
339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  31.14 
 
 
317 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  30.55 
 
 
306 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0202  aldo/keto reductase  27.18 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  28.93 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0272  aldo/keto reductase  26.25 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  30.69 
 
 
280 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0206  aldo/keto reductase  26.67 
 
 
393 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1186  aldo/keto reductase  28.43 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.472263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  27.02 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  25.36 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.46 
 
 
308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.15 
 
 
308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04961  aldo/keto reductase  26.23 
 
 
365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.583752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  29.32 
 
 
344 aa  114  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  30.86 
 
 
340 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  27.33 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0779  hypothetical protein  25.32 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000590838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1747  hypothetical protein  24.74 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482758  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  30.4 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  29.33 
 
 
279 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0701  aldo/keto reductase  26.32 
 
 
368 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135874  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0602  oxidoreductase  26.1 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  27.45 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1006  aldo/keto reductase family protein  27.55 
 
 
408 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  29.07 
 
 
285 aa  109  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  29.07 
 
 
285 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1328  aldo/keto reductase  27.27 
 
 
408 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118769  normal  0.0186788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  27.64 
 
 
306 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  27.03 
 
 
341 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  29.47 
 
 
283 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2110  aldo/keto reductase  27.51 
 
 
396 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.797322  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18751  aldo/keto reductase  27.32 
 
 
408 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
294 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  28.15 
 
 
312 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>