More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0376 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  70.92 
 
 		 305 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  50.33 
 
 		 308 aa  298  9e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  48.01 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  53.31 
 
 		 271 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  48.7 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  52.33 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  51.95 
 
 		 307 aa  285  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  48.94 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  46.73 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  46.08 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  45.42 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  49.45 
 
 		 302 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  48.49 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  48.16 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  49.64 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  50 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  48.26 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  48.68 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  47.25 
 
 		 272 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  46.91 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  46.55 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  49.63 
 
 		 301 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  46.84 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  46.23 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  44.55 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  45.91 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  42.55 
 
 		 345 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  40.14 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  40.29 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  41.35 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  37.37 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  39.78 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  38.34 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  29.39 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  28.82 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  28.82 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  29.48 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  28.37 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  28.89 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  31.27 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  31.69 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  27.54 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  26.37 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  30.24 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  31.82 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  30.67 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  27.01 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  25.72 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.38 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  28.39 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  24.65 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  32.08 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3345  aldo/keto reductase  28.51 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  25.94 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  29.66 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  27.88 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  30 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  29.46 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  28.85 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.3 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.44 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  30.16 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.08 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  26.47 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2757  aldo/keto reductase  26.19 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0729923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  27.6 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0536  putative aldose reductase  28.4 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0284216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  28.16 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.13 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  28.23 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1561  aldo/keto reductase  30.11 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  33.88 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  26.22 
 
 		 408 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  26.59 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  25.26 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  26.75 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  29.25 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  30 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1477  aldo/keto reductase  31.94 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  26.05 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  25.86 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  34.43 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  30.63 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.81 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  27.94 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  26.17 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  28.24 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  27.14 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  26.28 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  26.95 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  26.79 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  29.15 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  27.47 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3883  aldo/keto reductase  26.45 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0842  aryl-alcohol dehydrogenase  25.09 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>