More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0140 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0140  aldo/keto reductase  100 
 
 
281 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0208468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0534  aldo/keto reductase  55.94 
 
 
282 aa  296  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.76 
 
 
275 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
328 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  39.9 
 
 
328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  31.64 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  30.53 
 
 
294 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  34.4 
 
 
332 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  33.62 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  26.53 
 
 
351 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  34.57 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  34.57 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  31.99 
 
 
331 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1306  aldo/keto reductase  33.86 
 
 
287 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.139902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  31.38 
 
 
283 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  33.83 
 
 
338 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  32.33 
 
 
369 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  32.21 
 
 
341 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  32.34 
 
 
338 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  32.34 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  32.58 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  31.42 
 
 
337 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  31.72 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0104  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  32.82 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  31.76 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  34.84 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3300  aldo/keto reductase  34.08 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  30.17 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  34.19 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1410  aldo/keto reductase  33.99 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  29.38 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  29.32 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  28.44 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  30 
 
 
343 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  28.4 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.71 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0658  aldo/keto reductase  34.62 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  28.32 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1328  aldo/keto reductase  29.71 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118769  normal  0.0186788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  28.8 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2266  aldo/keto reductase  27.78 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000706888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  30.15 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  28.34 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  34.07 
 
 
341 aa  62  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  28.21 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  27.14 
 
 
376 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  26.53 
 
 
342 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  27.33 
 
 
376 aa  58.9  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  29.37 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  29.37 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0914  aldo/keto reductase  30.73 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.288271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  28.24 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0898  aldo/keto reductase  23.9 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  31.08 
 
 
326 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2110  aldo/keto reductase  29.1 
 
 
396 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.797322  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  24.44 
 
 
364 aa  56.2  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  25.33 
 
 
386 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0330  organophosphate reductase  31.29 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.318988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0350  morphine 6-dehydrogenase  30.54 
 
 
191 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.708797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  25.4 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1786  aldo/keto reductase  29.02 
 
 
280 aa  55.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.672029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  25.11 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  34.09 
 
 
332 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2834  aldo/keto reductase  29.94 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  26.23 
 
 
409 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1588  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1557  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0560  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
402 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  29.94 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  24.25 
 
 
431 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  31.3 
 
 
326 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  26.21 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  27.14 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  28.11 
 
 
328 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  24.87 
 
 
374 aa  52.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4129  aldo/keto reductase  32.82 
 
 
326 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0121527  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7472  aldo/keto reductase  30.17 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  27.27 
 
 
314 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  33.06 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  29.57 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5778  aldo/keto reductase  30.87 
 
 
326 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3138  aldo/keto reductase  29.31 
 
 
313 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2998  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.67 
 
 
283 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  25 
 
 
373 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3842  aldo/keto reductase  32.06 
 
 
326 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3956  aldo/keto reductase  31.78 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  30.92 
 
 
338 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4526  aldo/keto reductase  32.06 
 
 
326 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150764  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3075  2,5-didehydrogluconate reductase  26.67 
 
 
283 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  30.96 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  33.06 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  26.96 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4419  aldo/keto reductase  31.78 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1901  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.67 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  27.51 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  31.33 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1022  aldo/keto reductase  28.11 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527199  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  29.73 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>