More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2106 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  100 
 
 		 314 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  57.05 
 
 		 302 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  61.85 
 
 		 301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  67.86 
 
 		 323 aa  335  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  53.61 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  54.27 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  55.23 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  46.08 
 
 		 312 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  50 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  46.58 
 
 		 308 aa  275  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  49.64 
 
 		 311 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  46.74 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  50.75 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  47.06 
 
 		 303 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  48.05 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  47.12 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  45.75 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  46.84 
 
 		 271 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  46.13 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  44.55 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  46.04 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  45.68 
 
 		 309 aa  245  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  44.57 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  43.62 
 
 		 305 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  43.98 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  44.7 
 
 		 304 aa  235  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  44.6 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  42.49 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  42.42 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  46.55 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  44.49 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  40.74 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  35.83 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  29.67 
 
 		 279 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  34.47 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  28.52 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  30.77 
 
 		 275 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  35.56 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  29.92 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  30.3 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  30 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  29.73 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  27.36 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  25.46 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  26.03 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  28.34 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  25.37 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  27.69 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  27.24 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  26.48 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  32.26 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  27.39 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  30.55 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  31.3 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  29.13 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.08 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  28.47 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  28.47 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  27.7 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  32.99 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  27.05 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.69 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.69 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.69 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.69 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  26.32 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  28.11 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  29.12 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  27.66 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  26.73 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  29.39 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  27.2 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  28.1 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  29.65 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  28.19 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  28.19 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  28.19 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  26.93 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  27.55 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  33.14 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  29.81 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  28.25 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  28.25 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  28.52 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  30.23 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  27.62 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  28.9 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  29.55 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.35 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53850  oxidoreductase  31.05 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  29.02 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  32.08 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  26.78 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  28.77 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  29.68 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  27.05 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2442  aldo/keto reductase  30.95 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  24.91 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>