More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3802 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  100 
 
 
386 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  77.98 
 
 
369 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  63.23 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  61.79 
 
 
343 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  60.97 
 
 
311 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  61.02 
 
 
320 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  60.65 
 
 
311 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  54.67 
 
 
341 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  54.79 
 
 
343 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  54.97 
 
 
338 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  54.64 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  53.31 
 
 
338 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
347 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  46.42 
 
 
331 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.69 
 
 
275 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  31.97 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  30.91 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0534  aldo/keto reductase  30.54 
 
 
282 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  35.44 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  35.44 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  27.01 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  32.31 
 
 
337 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  27.41 
 
 
370 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  29.62 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  31.8 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  31.8 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  34.53 
 
 
332 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  33.04 
 
 
333 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  31.9 
 
 
283 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1306  aldo/keto reductase  31.07 
 
 
287 aa  103  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.139902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.81 
 
 
350 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  31.7 
 
 
333 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  35.19 
 
 
296 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3239  aldo/keto reductase  29.61 
 
 
313 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3138  aldo/keto reductase  29.93 
 
 
313 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  35.81 
 
 
345 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  35.81 
 
 
345 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  33.76 
 
 
322 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  27.34 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3040  aldo/keto reductase  28.95 
 
 
313 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.292079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  34.39 
 
 
326 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0140  aldo/keto reductase  31.76 
 
 
281 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0208468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  32.89 
 
 
344 aa  93.6  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  30.36 
 
 
338 aa  92.8  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  34.29 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  33.48 
 
 
326 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  29.55 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  33.48 
 
 
326 aa  92  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  33.48 
 
 
332 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  30.57 
 
 
349 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  31.28 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0341  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
296 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000752262  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  32.57 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  33.53 
 
 
315 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  34.24 
 
 
285 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0104  aldo/keto reductase  28.77 
 
 
294 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  31.33 
 
 
335 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
331 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  31.28 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  31.62 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1410  aldo/keto reductase  35.36 
 
 
285 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  34.43 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  33.18 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  32.19 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  23.91 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  32.71 
 
 
294 aa  86.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  30.87 
 
 
335 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  32 
 
 
343 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  25.44 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  31.49 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  33.49 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  30.45 
 
 
326 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  29.8 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  31.48 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  32.58 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  32.46 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  26.27 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  27.48 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  30.08 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  32.44 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  25.62 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  32.3 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  32.47 
 
 
325 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  26.74 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4129  aldo/keto reductase  29.91 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0121527  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  30.87 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  30.91 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  29.31 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3018  aldo/keto reductase  28.9 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  29.78 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  28.23 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0658  aldo/keto reductase  33.85 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  25.32 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  33.04 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  30.8 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>