More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3061 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  100 
 
 		 371 aa  776    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  51.73 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  50.54 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  49.87 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  50.13 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  49.87 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  48.68 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  49.2 
 
 		 377 aa  362  6e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  45.89 
 
 		 383 aa  346  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  43.77 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  44.33 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  46.03 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  44.91 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  44.36 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  44.09 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  44 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  42.49 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  43.65 
 
 		 406 aa  316  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  43.93 
 
 		 399 aa  315  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  43.9 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  43.19 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  40.73 
 
 		 408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  41.19 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  44.68 
 
 		 410 aa  306  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.36 
 
 		 382 aa  305  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  42.44 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  42.56 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  42.71 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  39.89 
 
 		 413 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  39.15 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  37.74 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  38.4 
 
 		 370 aa  232  7.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  39.42 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2587  aldo/keto reductase  34.51 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  36.04 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1621  aldo/keto reductase  33.6 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1057  aldo/keto reductase  34.41 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286681 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  34.58 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  32.41 
 
 		 364 aa  186  8e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0701  aldo/keto reductase  31.18 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135874  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  31.84 
 
 		 364 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  28.15 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  26.04 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  26.61 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  27.96 
 
 		 365 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  25.91 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  27.32 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  25 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  34.68 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  34.21 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  23.85 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  23.79 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  29.71 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  25.39 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  26.08 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  30.56 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.07 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  30.6 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  32.11 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0602  oxidoreductase  24.41 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.47 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.03 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  28.84 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  26.98 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0440  aldo/keto reductase  25.38 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  21.73 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0779  hypothetical protein  24.56 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000590838 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04651  aldo/keto reductase  24.68 
 
 		 380 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.205889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  31.48 
 
 		 296 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  27.19 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  28.11 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  28.87 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  28.11 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  28.33 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04381  aldo/keto reductase  23.81 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4324  aldo/keto reductase  28.14 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  27.57 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  29.17 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  32.11 
 
 		 312 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1186  aldo/keto reductase  29.87 
 
 		 393 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.472263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4535  aldo/keto reductase  27.47 
 
 		 394 aa  89.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0927734  decreased coverage  0.00892549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  27.48 
 
 		 302 aa  89.4  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  29.29 
 
 		 281 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  27.05 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  27.55 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  29.17 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  31.44 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  27.78 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  31.58 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  33.64 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  30.36 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  28.03 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0202  aldo/keto reductase  24.54 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  26.86 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  31.17 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>