More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1653 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  100 
 
 
381 aa  800    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  62.73 
 
 
380 aa  497  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  60.42 
 
 
400 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  58.36 
 
 
399 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  58.47 
 
 
400 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.89 
 
 
382 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  56.5 
 
 
406 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  56.17 
 
 
398 aa  434  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  53.87 
 
 
384 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  55.44 
 
 
383 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  56.69 
 
 
397 aa  425  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  54.09 
 
 
400 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  54.52 
 
 
399 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  52.34 
 
 
377 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  52.91 
 
 
377 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  50.66 
 
 
401 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  52.79 
 
 
413 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  49.87 
 
 
376 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  48.82 
 
 
409 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  49.47 
 
 
376 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  48.03 
 
 
408 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  48.29 
 
 
409 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  51.6 
 
 
410 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  47.62 
 
 
396 aa  359  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  48.54 
 
 
379 aa  358  9e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  46.49 
 
 
379 aa  357  9.999999999999999e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  48.28 
 
 
379 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  43.68 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  43.19 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  44.18 
 
 
397 aa  305  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  41.24 
 
 
374 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  37.17 
 
 
376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  35.36 
 
 
370 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  36.29 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1057  aldo/keto reductase  35.19 
 
 
374 aa  196  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286681 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0701  aldo/keto reductase  33.24 
 
 
368 aa  193  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135874  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  33.42 
 
 
379 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  34.63 
 
 
364 aa  185  9e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2587  aldo/keto reductase  32.01 
 
 
368 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465282  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1621  aldo/keto reductase  31.13 
 
 
380 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  29.27 
 
 
386 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  28.05 
 
 
371 aa  152  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  28.98 
 
 
374 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  28.87 
 
 
374 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  28.35 
 
 
376 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  29.35 
 
 
365 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  28.91 
 
 
337 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  25.46 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  27.01 
 
 
383 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  27.84 
 
 
364 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  25.79 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.17 
 
 
350 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  27.16 
 
 
373 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  30.43 
 
 
320 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0602  oxidoreductase  25.53 
 
 
373 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  25.19 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  29.01 
 
 
345 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  32.27 
 
 
311 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  25.08 
 
 
312 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  27.78 
 
 
315 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  28.47 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  24.75 
 
 
308 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  24.75 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.97 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0440  aldo/keto reductase  23.06 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2569  aldo/keto reductase  26.29 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133654  normal  0.0183091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  27.37 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04651  aldo/keto reductase  24.5 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.205889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0779  hypothetical protein  22.17 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000590838 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  24.56 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  27.08 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05031  aldo/keto reductase  24.78 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  27.78 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  27.78 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  29.3 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  31.36 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  26.76 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  28.53 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1760  oxidoreductase  24.03 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  26.21 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  28 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  24.5 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0272  aldo/keto reductase  22 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  27.4 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2478  oxidoreductase  27.33 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  24.58 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2873  hypothetical protein  25.24 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  26.95 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  28.22 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  26.76 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04961  aldo/keto reductase  23.12 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.583752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  26.12 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  28.36 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  27.19 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>