More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3250 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  100 
 
 
364 aa  760    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  37.93 
 
 
365 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  30.87 
 
 
374 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  32.72 
 
 
376 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  32.11 
 
 
376 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  30.79 
 
 
377 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  29.95 
 
 
400 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  31.84 
 
 
371 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  30.65 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  30.79 
 
 
396 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  29.61 
 
 
379 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  29.87 
 
 
379 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  28.5 
 
 
384 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  27.13 
 
 
383 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  27.13 
 
 
379 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  26.56 
 
 
406 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
400 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  27.15 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  28.46 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
398 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  29.24 
 
 
376 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  27.58 
 
 
400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  28.16 
 
 
397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  28.2 
 
 
381 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  28.93 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  27.01 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.77 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  26.84 
 
 
408 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  30.29 
 
 
340 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  27.84 
 
 
381 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  29.35 
 
 
337 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  28.42 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  28.06 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  26.23 
 
 
370 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  28.65 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  28.09 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1621  aldo/keto reductase  29.82 
 
 
380 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  29.62 
 
 
375 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  29.02 
 
 
379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  24.47 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  26.92 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2587  aldo/keto reductase  27.85 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1057  aldo/keto reductase  26.2 
 
 
374 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  26.51 
 
 
386 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0701  aldo/keto reductase  26.86 
 
 
368 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135874  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  28.05 
 
 
343 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  27.01 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  25 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  25.07 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  25.33 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  26.27 
 
 
376 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  23.86 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  26.13 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  24.15 
 
 
376 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  24.87 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  23.96 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  26.43 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.13 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0202  aldo/keto reductase  25.23 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0206  aldo/keto reductase  25.23 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.68 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1533  aldo/keto reductase  26.47 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  25.68 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  25.68 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.13 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.68 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.68 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.86 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4324  aldo/keto reductase  28.14 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  24.58 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  28.96 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  23.51 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3654  aldo/keto reductase  30.61 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  27.23 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  23.62 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  24.68 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  24.01 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.84 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  27.22 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  23.72 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  25.31 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  26.5 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  27.03 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0779  hypothetical protein  23.14 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000590838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  26.13 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  26.58 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  24.92 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  24.92 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  35.25 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  24.18 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2110  aldo/keto reductase  23.62 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.797322  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  25.48 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  25.93 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1541  aldo/keto reductase  26.06 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.941337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  33.55 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  25.94 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  27.74 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06351  aldo/keto reductase family protein  21.81 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  27.68 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>