More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0529 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  100 
 
 
400 aa  828    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  63.84 
 
 
400 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  63 
 
 
400 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  64.41 
 
 
406 aa  548  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  63.25 
 
 
399 aa  541  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  62.06 
 
 
398 aa  521  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  58.7 
 
 
397 aa  478  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  59.42 
 
 
399 aa  463  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  54.71 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  55.76 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  53.09 
 
 
413 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  51.43 
 
 
409 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  50.65 
 
 
409 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  54.09 
 
 
381 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.84 
 
 
382 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  51.17 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  52.12 
 
 
380 aa  396  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  49.35 
 
 
408 aa  397  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  52.16 
 
 
379 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  48.31 
 
 
384 aa  388  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  49.08 
 
 
376 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  49.61 
 
 
377 aa  388  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  48.56 
 
 
396 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  45.95 
 
 
377 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  47.73 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  44.91 
 
 
379 aa  342  7e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  44.65 
 
 
379 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  42.23 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  44.56 
 
 
397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  44.36 
 
 
371 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  38.27 
 
 
374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  35.88 
 
 
370 aa  209  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  35.04 
 
 
376 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  36.02 
 
 
374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  34.65 
 
 
375 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  32.55 
 
 
379 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  32.7 
 
 
364 aa  189  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2587  aldo/keto reductase  32.8 
 
 
368 aa  189  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1057  aldo/keto reductase  34.56 
 
 
374 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1621  aldo/keto reductase  31.66 
 
 
380 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0701  aldo/keto reductase  30.53 
 
 
368 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135874  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  28.64 
 
 
386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
364 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  29.22 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  26.77 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  26.29 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  26.44 
 
 
383 aa  126  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  29.09 
 
 
337 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  26.82 
 
 
374 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  26.98 
 
 
374 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  26.3 
 
 
376 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  27.04 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  29.72 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0602  oxidoreductase  27.62 
 
 
373 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  25.96 
 
 
340 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04381  aldo/keto reductase  27.22 
 
 
378 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1760  oxidoreductase  27.82 
 
 
373 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05031  aldo/keto reductase  24.81 
 
 
380 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  27.11 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  28.8 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  30.92 
 
 
320 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06351  aldo/keto reductase family protein  27.07 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.5 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
311 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04651  aldo/keto reductase  25.13 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.205889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  30.34 
 
 
327 aa  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  25.69 
 
 
370 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0440  aldo/keto reductase  25.13 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04961  aldo/keto reductase  25.13 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.583752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  36.77 
 
 
311 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  27.7 
 
 
343 aa  86.3  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  29.15 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  32.59 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  29.21 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  29.05 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  29.36 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  27.59 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  29.32 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  30.66 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  26.64 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  29.51 
 
 
302 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  31.46 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  29.26 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  25.87 
 
 
326 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  26.17 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0202  aldo/keto reductase  24.74 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  27.16 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  28.34 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  28.52 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  27.39 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  26.43 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  28.29 
 
 
334 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  28.71 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0669  aldo/keto reductase  29.88 
 
 
333 aa  77  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  27.53 
 
 
331 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  27.87 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>