More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3085 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  100 
 
 
311 aa  643    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  91.32 
 
 
311 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  73.55 
 
 
320 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  65.89 
 
 
345 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  62.58 
 
 
343 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  60.67 
 
 
341 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  60.65 
 
 
386 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  56.13 
 
 
369 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  59.12 
 
 
338 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  58.78 
 
 
338 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  58.45 
 
 
338 aa  362  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  57.09 
 
 
343 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  46.62 
 
 
347 aa  261  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  36.46 
 
 
332 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
280 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  35.07 
 
 
294 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.57 
 
 
275 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  35.77 
 
 
328 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  35.38 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  35.74 
 
 
337 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  34.33 
 
 
285 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  34.33 
 
 
285 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  30 
 
 
370 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  30.37 
 
 
370 aa  125  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  30.42 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0534  aldo/keto reductase  30.63 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  34.68 
 
 
371 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
377 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  29.24 
 
 
283 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  36.2 
 
 
343 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  30.63 
 
 
376 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  29.6 
 
 
384 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
376 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  32.74 
 
 
333 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
379 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  27.13 
 
 
377 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
379 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  32.74 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  33.48 
 
 
376 aa  99  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  35.71 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  34.98 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  36.32 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  38.01 
 
 
342 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
383 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  33.91 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4129  aldo/keto reductase  34.62 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0121527  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  32.77 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  33.91 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  34.67 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  35.56 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  33.01 
 
 
379 aa  94  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  33.61 
 
 
324 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  33.64 
 
 
316 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  34.87 
 
 
324 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  31.94 
 
 
343 aa  92.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  33.61 
 
 
326 aa  92.4  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  34.09 
 
 
341 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  32.48 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  33.9 
 
 
327 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  34.82 
 
 
339 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  34.82 
 
 
344 aa  91.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  29.63 
 
 
399 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  34.53 
 
 
343 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  31.84 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  31.36 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.77 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  32.35 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  32.35 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  33.48 
 
 
368 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  32.35 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  32.35 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.35 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.35 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
400 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.35 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5778  aldo/keto reductase  33.05 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  34.22 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  33.05 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  34.08 
 
 
340 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  34.27 
 
 
294 aa  89.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  32.88 
 
 
341 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.31 
 
 
324 aa  89  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  30.6 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  33.94 
 
 
343 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  33.05 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  31.65 
 
 
326 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  32.76 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3138  aldo/keto reductase  31.54 
 
 
313 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.89 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  33.74 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  34.19 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  32.74 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  30.26 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  25.9 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3239  aldo/keto reductase  31.21 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3018  aldo/keto reductase  31.54 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  32.91 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>