More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1193 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  100 
 
 		 311 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  91.32 
 
 		 311 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  72.26 
 
 		 320 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  65.89 
 
 		 345 aa  421  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  61.59 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  62 
 
 		 341 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  60.97 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  60.14 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  56.45 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  59.46 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  59.46 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  57.43 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  45.95 
 
 		 347 aa  255  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  34.43 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  34.24 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  35.02 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.64 
 
 		 275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  33.47 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  35.27 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  34.33 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  34.33 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  34.88 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  36.26 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  29.7 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  29.63 
 
 		 370 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  28.89 
 
 		 370 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  34.21 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0534  aldo/keto reductase  29.52 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  29.24 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  29.6 
 
 		 384 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  29.15 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  29.75 
 
 		 377 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  32.12 
 
 		 377 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  33.18 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  33.5 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  28.67 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  33.5 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  34.55 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  32.74 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  32.74 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  33.94 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  33.91 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  30.99 
 
 		 383 aa  95.9  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  34.22 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  31.14 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4129  aldo/keto reductase  33.76 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0121527  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  34.82 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  31.93 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  34.38 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  33.75 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  32.74 
 
 		 338 aa  91.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  36.2 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  32.62 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  31.49 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  32.43 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  33.19 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 334 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.09 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  33.18 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  29.55 
 
 		 379 aa  89.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  33.47 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  32.86 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  33.63 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0460  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.71 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  32.97 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  30.53 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  32.3 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  30.77 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  33.18 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  30.67 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  30.67 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  32.43 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  33.18 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.67 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  30.67 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0462  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.71 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  30.67 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.67 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.67 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  31.84 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0481  putative aryl-alcohol dehydrogenase W  30.71 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0523  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.71 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0468  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.71 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  32.48 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  29.92 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  32.9 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  31.62 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  33.04 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1418  aldo/keto reductase  31.58 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  32.27 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  30.73 
 
 		 343 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.57 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18200  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.9 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  36.77 
 
 		 400 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  28.11 
 
 		 399 aa  86.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>