More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1328 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1328  aldo/keto reductase  100 
 
 
408 aa  849    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118769  normal  0.0186788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0560  aldo/keto reductase  34.63 
 
 
402 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2773  aldo/keto reductase  38.57 
 
 
371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0765683  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2110  aldo/keto reductase  29.38 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.797322  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  27.27 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  27.27 
 
 
376 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  27.94 
 
 
384 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  27.52 
 
 
337 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  26.15 
 
 
377 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
377 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  26.75 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  28.79 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  23.88 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  27.18 
 
 
379 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  30.22 
 
 
294 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  27.18 
 
 
379 aa  92.8  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  26.89 
 
 
408 aa  93.2  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.56 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  27.51 
 
 
383 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  26.36 
 
 
409 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  25.33 
 
 
376 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.14 
 
 
275 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.46 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  28.3 
 
 
280 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  25.91 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  31.08 
 
 
338 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  31.92 
 
 
331 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  26.91 
 
 
401 aa  87.4  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  27.43 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  25.27 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  31.97 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  34.88 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  34.88 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  24.81 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  24.16 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  30.6 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  28.3 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.86 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  28.63 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  30.28 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.26 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0104  aldo/keto reductase  29.19 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  28.91 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  24.8 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  28.08 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  27.98 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0534  aldo/keto reductase  28.64 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  25 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  28.79 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  27.88 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  32 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
270 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  26.92 
 
 
349 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  29.48 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  25.26 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2266  aldo/keto reductase  26.64 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000706888 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  27.05 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  28.63 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  25.4 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  29.11 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  27.85 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  34.62 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  30.95 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1641  aldo/keto reductase  26.56 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.316031  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.16 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  28.19 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  27.83 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  27.08 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  25.8 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  29.47 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  28.93 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  28.93 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  24.01 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  26.92 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  28.8 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  28.73 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  27.35 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  28.16 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  24.6 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  23.32 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15961  aldo/keto reductase  29.92 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  26.24 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  27.36 
 
 
343 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.04 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  34.44 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5167  aldo/keto reductase  27.31 
 
 
326 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  32.16 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  27.83 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1533  aldo/keto reductase  27.01 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  27.23 
 
 
326 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  32.47 
 
 
327 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
353 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  34.16 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02340  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  26.53 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  26.91 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  27.32 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>