More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0560 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0560  aldo/keto reductase  100 
 
 
402 aa  838    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1328  aldo/keto reductase  34.63 
 
 
408 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118769  normal  0.0186788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2773  aldo/keto reductase  30.39 
 
 
371 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0765683  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2110  aldo/keto reductase  28.36 
 
 
396 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.797322  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  24.93 
 
 
374 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  25.26 
 
 
376 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  28.9 
 
 
280 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  24.93 
 
 
337 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  29.63 
 
 
285 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  29.63 
 
 
285 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  22.6 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  24.48 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  26.9 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.09 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  24.61 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  25.87 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  24.61 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  24.5 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
376 aa  77  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  23.65 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  23.1 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  21.7 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  22.6 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  24.09 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  23.5 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  24.08 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  30.2 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  24.45 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.98 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.98 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  22.92 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  21.67 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  23.28 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  23.28 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  25.22 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  22.41 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  25.07 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  31.52 
 
 
309 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  23.73 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  23.31 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  34.16 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  26.28 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2266  aldo/keto reductase  26.38 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000706888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  29.7 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  26.28 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  29.91 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  26.6 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  27.31 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  23.32 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  23.23 
 
 
351 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  36.8 
 
 
303 aa  67  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  29.88 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  23.9 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1306  aldo/keto reductase  25.62 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.139902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0669  aldo/keto reductase  30.81 
 
 
333 aa  66.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15961  aldo/keto reductase  27.49 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  28.73 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
337 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  22.11 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  23.58 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  31.03 
 
 
281 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  29.76 
 
 
330 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3770  aldo/keto reductase  30.54 
 
 
339 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.730632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  26.33 
 
 
311 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
323 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  28.92 
 
 
328 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  32.34 
 
 
317 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  22.57 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  31.07 
 
 
328 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  27.49 
 
 
293 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  32.02 
 
 
326 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  25 
 
 
288 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  21.78 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  31.52 
 
 
342 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  31.21 
 
 
323 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  33.54 
 
 
316 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  32.69 
 
 
325 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  26.28 
 
 
410 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  29.11 
 
 
333 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.16 
 
 
315 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  27.55 
 
 
324 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2701  aldo/keto reductase  34.84 
 
 
325 aa  63.2  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.117556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  30.92 
 
 
316 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.16 
 
 
331 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  25.91 
 
 
281 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
339 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1006  aldo/keto reductase family protein  26.24 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
281 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
281 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3239  aldo/keto reductase  30.13 
 
 
364 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13922  normal  0.0117807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
281 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1557  aldo/keto reductase  30.23 
 
 
302 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.16 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  28.08 
 
 
330 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.16 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.16 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.16 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1588  aldo/keto reductase  30.23 
 
 
302 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  30.63 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>