More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3568 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3568  aldo/keto reductase  100 
 
 
313 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.780861  normal  0.215858 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0202  oxidoreductase  33.55 
 
 
302 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1244  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
312 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0582  aldo/keto reductase  29.74 
 
 
297 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.86981  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0672  aldo/keto reductase  27.72 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  26.02 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1063  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.74 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.730153  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1557  aldo/keto reductase  26.8 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1588  aldo/keto reductase  26.8 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0062  bifunctional regulator KidO  24.09 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.99559  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  27.83 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  25.78 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  26.49 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.49 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.49 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  26.49 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  26.49 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.49 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  26.02 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  26.54 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  25.52 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  29.27 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1895  aldo/keto reductase  25.94 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  26.52 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.79 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  26.96 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  27.83 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  25.44 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.82 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  25.96 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  24.07 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  25.41 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.83 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.49 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  26.27 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  24.17 
 
 
358 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1775  aldo/keto reductase  25.63 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.2 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.2 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.2 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.2 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  25.24 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  25.41 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.2 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4912  aldo/keto reductase  25.42 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0730904  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  26.09 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2657  aldo/keto reductase  25.69 
 
 
330 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0091  hypothetical protein  23.84 
 
 
294 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.402529  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  25.36 
 
 
351 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  26.23 
 
 
329 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  26.92 
 
 
339 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  25.94 
 
 
304 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  24.21 
 
 
331 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  26.04 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  26.37 
 
 
331 aa  62.4  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  25.07 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  25.07 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  23.8 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  22.53 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4313  aldo-keto reductase  24.52 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  23.62 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0768  aldo/keto reductase  24.86 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  24.83 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.57 
 
 
332 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3430  aldo-keto reductase  24.2 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3470  aldo-keto reductase  24.2 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  26.32 
 
 
374 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.51 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3287  aldo-keto reductase  24.2 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
329 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0341  aldo/keto reductase  24.41 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000752262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  23.6 
 
 
331 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  23.8 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  26.63 
 
 
311 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  26.1 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  25.17 
 
 
304 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  25.24 
 
 
341 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  22.56 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  25.76 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.76 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  23.64 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  23.82 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  25.76 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2345  aldo/keto reductase  24.91 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.172822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0850  aldo/keto reductase  25.39 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  32.9 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  25.76 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02876  aldo-keto reductase  23.89 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0696  aldo/keto reductase  23.89 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  26.32 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0599  aldo/keto reductase  26.86 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.67 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2293  oxidoreductase  24.61 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0207177  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  24.23 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02826  hypothetical protein  23.89 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3180  aldo-keto reductase  23.89 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  23.33 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>