More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2305 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2305  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3160  two component transcriptional regulator  75 
 
 		 295 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.272458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.58 
 
 		 276 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00294817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  35.63 
 
 		 266 aa  141  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0818  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000529672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.46 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  27.67 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  31.6 
 
 		 220 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4049  two component transcriptional regulator  28.85 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  30.68 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  34 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0452  response regulator ompr  28.35 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.35 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.95 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  31.78 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.11 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  31.01 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.2 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 219 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  30.98 
 
 		 236 aa  97.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3209  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory proteinphoP  31.17 
 
 		 220 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.79 
 
 		 227 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4152  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 480 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.038607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.38 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  28.35 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.46 
 
 		 236 aa  96.3  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.57 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 226 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  27.82 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  29.96 
 
 		 225 aa  95.5  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  28.06 
 
 		 226 aa  95.5  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  28.85 
 
 		 237 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.98 
 
 		 246 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  32.55 
 
 		 227 aa  95.5  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.37 
 
 		 240 aa  95.5  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 233 aa  95.5  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.06 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  30.68 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  29.34 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3375  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 461 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  27.31 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.57 
 
 		 472 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  28.19 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  27.31 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  28.11 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  26.91 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0445  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.98 
 
 		 481 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  31.43 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 470 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.68 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  30.98 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.8 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6736  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.31 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.523736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  26.91 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  26.25 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  28.06 
 
 		 470 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  26.91 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.43 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  31.02 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  26.91 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0417  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 474 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.45134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  30.98 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  29.62 
 
 		 239 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  26.38 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  27.91 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  29.62 
 
 		 239 aa  94  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  28.19 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  28.52 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  31.87 
 
 		 222 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0446  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.98 
 
 		 481 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4983  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.79 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  31.47 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  30.27 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  30.2 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.48 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  26.51 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  26.51 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  28.19 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  28.19 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  28.19 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  28.19 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.76 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  28.19 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  29.72 
 
 		 225 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  28.19 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 229 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  28.63 
 
 		 223 aa  92.4  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  25.98 
 
 		 228 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  28.91 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>