116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1990 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1990  alkaline phosphatase  100 
 
 		 524 aa  1064    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.678099  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3268  alkaline phosphatase  92.75 
 
 		 524 aa  1000    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0787  alkaline phosphatase  41.13 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0785  Alkaline phosphatase  41.4 
 
 		 1032 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  27.34 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  24.16 
 
 		 464 aa  93.6  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  23.82 
 
 		 426 aa  93.6  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  26.79 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3577  alkaline phosphatase  24.58 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0130051  normal  0.0343201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  24.89 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  24.55 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  23.61 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  24.51 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  24.94 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  25.4 
 
 		 388 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  24.77 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  25.38 
 
 		 480 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  24 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  24.77 
 
 		 577 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  24.82 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  25 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  25 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  21.99 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  24.55 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  23.86 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134835 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  21.04 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  21.04 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  22.24 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  21.96 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  22.51 
 
 		 581 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  24.14 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  25 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  25 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  22.48 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  23.34 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  23.12 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  23.22 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  23.8 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  22.85 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  22.07 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  22.85 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  22.85 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  22.85 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  22.85 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  22.85 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  22.8 
 
 		 581 aa  59.3  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  23.13 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  23.13 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  22.96 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  23.49 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  25.58 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  23.13 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  22.85 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  23.59 
 
 		 671 aa  58.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  23.5 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  23.13 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  23.69 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  24.12 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  22.78 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  24.2 
 
 		 461 aa  57  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  23.62 
 
 		 609 aa  57  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  22.86 
 
 		 461 aa  57  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  22.86 
 
 		 461 aa  57  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  24.26 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  21.77 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  24.28 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  23.13 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  22.66 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  22.73 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  23.1 
 
 		 518 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  20.63 
 
 		 536 aa  53.5  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  22.45 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  22.88 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  22.75 
 
 		 584 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  24.14 
 
 		 565 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  22.64 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  22.93 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  22.5 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  23.82 
 
 		 481 aa  51.6  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  23.53 
 
 		 505 aa  51.6  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  26.98 
 
 		 439 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  22.25 
 
 		 584 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  24.28 
 
 		 467 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  21.66 
 
 		 554 aa  51.2  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  20.26 
 
 		 476 aa  51.2  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  22.51 
 
 		 582 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  21.94 
 
 		 559 aa  50.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  23.38 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  26.98 
 
 		 425 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  26.98 
 
 		 439 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  26.98 
 
 		 439 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  22.52 
 
 		 589 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  18.97 
 
 		 489 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  25.93 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  25.93 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  25.4 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  25.93 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  29.9 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  23.22 
 
 		 640 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  23.42 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>