More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4655 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1775  argininosuccinate lyase  85.59 
 
 		 509 aa  838    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1945  argininosuccinate lyase  73.89 
 
 		 533 aa  715    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000741836  normal  0.0116194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4655  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 508 aa  1039    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49320  L-aspartate-like protein  45.74 
 
 		 532 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0630  fumarate lyase  43.05 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  0.423973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3252  argininosuccinate lyase  28.38 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3258  argininosuccinate lyase  27.77 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3557  argininosuccinate lyase  28.12 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  30.9 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  29.65 
 
 		 513 aa  177  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3343  argininosuccinate lyase  28.12 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3604  argininosuccinate lyase  28.12 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0284703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  27.46 
 
 		 502 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  29.47 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  27.11 
 
 		 491 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3657  argininosuccinate lyase  26.58 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  27.06 
 
 		 487 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2224  argininosuccinate lyase  27.83 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.432614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3567  argininosuccinate lyase  26.36 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1660  argininosuccinate lyase  27.02 
 
 		 502 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033744 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  27.41 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  30.39 
 
 		 492 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  27.09 
 
 		 481 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  27.45 
 
 		 481 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2584  argininosuccinate lyase  27.59 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0126458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  28.72 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  25.85 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  24.85 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  27.87 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  27.16 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  28.71 
 
 		 481 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  26.12 
 
 		 510 aa  147  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  28.39 
 
 		 463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2629  argininosuccinate lyase  31.13 
 
 		 499 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.367608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 462 aa  146  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  25.12 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  24.88 
 
 		 463 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  25.12 
 
 		 462 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  26.22 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  26.68 
 
 		 492 aa  143  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  25.41 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  24.71 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2390  argininosuccinate lyase  28.37 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438224  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  28 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  24.88 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  27.39 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  25.71 
 
 		 497 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  28.61 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  26.57 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  25.95 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  28.72 
 
 		 459 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  28.18 
 
 		 474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  24.15 
 
 		 459 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  24.15 
 
 		 459 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  25.47 
 
 		 467 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  26.32 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  29.94 
 
 		 458 aa  136  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3564  argininosuccinate lyase  29.12 
 
 		 323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  27.14 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  26.4 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  27.25 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  27.11 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  26.39 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  23.44 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  29.02 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  26.28 
 
 		 441 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  26.85 
 
 		 465 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  26.62 
 
 		 485 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  27.99 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  25.33 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  28.02 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  26.14 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  27.15 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  26.78 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  26.78 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  27.86 
 
 		 499 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  27.61 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0488  argininosuccinate lyase  25.71 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.196592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3098  argininosuccinate lyase  29.17 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  29.38 
 
 		 476 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  30.25 
 
 		 459 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  26.24 
 
 		 463 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  27.53 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  26.6 
 
 		 465 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  24.6 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  27.15 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  26.54 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  27.47 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  25.6 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  26.48 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  27.99 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  26.74 
 
 		 457 aa  128  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  27.81 
 
 		 624 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  27.14 
 
 		 488 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  24.11 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  30.59 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>