More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1775 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1945  argininosuccinate lyase  74.57 
 
 		 533 aa  723    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000741836  normal  0.0116194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1775  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 509 aa  1041    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4655  argininosuccinate lyase  81.53 
 
 		 508 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49320  L-aspartate-like protein  45.53 
 
 		 532 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0630  fumarate lyase  41.94 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  0.423973 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  30.63 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3252  argininosuccinate lyase  27.18 
 
 		 502 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272341  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  30.64 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3258  argininosuccinate lyase  25.9 
 
 		 502 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3557  argininosuccinate lyase  27.48 
 
 		 502 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  29.29 
 
 		 513 aa  170  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  26.3 
 
 		 491 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  26.02 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3343  argininosuccinate lyase  27.04 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3604  argininosuccinate lyase  27.04 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0284703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3657  argininosuccinate lyase  26.79 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2224  argininosuccinate lyase  28.43 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.432614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3567  argininosuccinate lyase  26.59 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  28.07 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  27.08 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  30.51 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  27.08 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  26.62 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  26.6 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1660  argininosuccinate lyase  27 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  28.64 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2584  argininosuccinate lyase  29.05 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0126458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  25.41 
 
 		 487 aa  148  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  26.85 
 
 		 481 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  28.64 
 
 		 481 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  28.21 
 
 		 502 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  25.6 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  26.35 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2629  argininosuccinate lyase  29.92 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.367608  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  27.78 
 
 		 494 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  29.11 
 
 		 624 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  29.94 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  25.37 
 
 		 497 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  25.7 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  25.47 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  25.47 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  26.86 
 
 		 456 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  27.59 
 
 		 458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  29.45 
 
 		 471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  25.47 
 
 		 462 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  25.93 
 
 		 462 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  26.9 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  25.93 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  27.94 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  25.72 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  28.42 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  25.28 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  25.85 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  25.7 
 
 		 460 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.28 
 
 		 624 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  25.23 
 
 		 462 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  25.13 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  27.05 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  25.13 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  26.15 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  26.5 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  23.11 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  26.72 
 
 		 499 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  26.43 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  25.58 
 
 		 492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  25.97 
 
 		 464 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  29.69 
 
 		 476 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3564  argininosuccinate lyase  28.22 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  28.98 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  26.39 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  28.04 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  26.08 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  24.84 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  27.1 
 
 		 520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  26.63 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2482  argininosuccinate lyase  29.4 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199461  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  27.2 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  28.22 
 
 		 462 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  25.58 
 
 		 502 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  25.37 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  25.58 
 
 		 499 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2217  argininosuccinate lyase  26.8 
 
 		 458 aa  127  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  27.74 
 
 		 476 aa  127  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  27.81 
 
 		 626 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  26.53 
 
 		 457 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1043  argininosuccinate lyase  24.89 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  27.41 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  25.89 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  25.69 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  28.88 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  27.51 
 
 		 462 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  28.88 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  26.99 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  29.53 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  30.07 
 
 		 624 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  25.31 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  26.84 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  29.24 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  28.38 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>