More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0630 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0630  fumarate lyase  100 
 
 		 496 aa  986    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  0.423973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49320  L-aspartate-like protein  47.39 
 
 		 532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1945  argininosuccinate lyase  42.52 
 
 		 533 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000741836  normal  0.0116194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1775  argininosuccinate lyase  41.53 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4655  argininosuccinate lyase  42.37 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  32.21 
 
 		 491 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  34.24 
 
 		 459 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3252  argininosuccinate lyase  29.93 
 
 		 502 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2224  argininosuccinate lyase  31.45 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.432614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  29.02 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3258  argininosuccinate lyase  28.96 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  32.28 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  29.61 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2584  argininosuccinate lyase  34.98 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0126458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3557  argininosuccinate lyase  30.13 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  33.95 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3343  argininosuccinate lyase  30.13 
 
 		 502 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3604  argininosuccinate lyase  30.13 
 
 		 502 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0284703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  28.91 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  28.76 
 
 		 481 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  31.88 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1660  argininosuccinate lyase  28.69 
 
 		 502 aa  181  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  33.71 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  33.49 
 
 		 463 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  32.36 
 
 		 469 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  31.63 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  29.06 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3657  argininosuccinate lyase  28.9 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  32.11 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  32.15 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3567  argininosuccinate lyase  28.07 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  30.63 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  28.95 
 
 		 481 aa  177  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  29.27 
 
 		 469 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  32.9 
 
 		 478 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  32.17 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  32.41 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  31.58 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2482  argininosuccinate lyase  37.96 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199461  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  29.34 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  30.98 
 
 		 509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 471 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  30.65 
 
 		 476 aa  173  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  30.89 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  31.03 
 
 		 470 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  32.13 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  28.27 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  30.79 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  31.6 
 
 		 467 aa  170  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 		 471 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  34.6 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  36.28 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  28.61 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 469 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 469 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  29.3 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 469 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  31.36 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  28.61 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 469 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  29.35 
 
 		 462 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  30.64 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  30.79 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 469 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  28.61 
 
 		 462 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  32.47 
 
 		 455 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 489 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  30.39 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  30.66 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  37.91 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  28.61 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  28.39 
 
 		 463 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  34.23 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  28.61 
 
 		 463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  28.27 
 
 		 462 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  31.64 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  30.48 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  28.53 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  30.23 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  29.5 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  30.18 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  33.93 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  30.72 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  30.72 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  30.72 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  33.93 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  28.35 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  30.72 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  28.61 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  31.53 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  31.41 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  33.93 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>