32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4490 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  100 
 
 		 352 aa  708    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.42 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.83 
 
 		 358 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  35.49 
 
 		 327 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  35.49 
 
 		 327 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  33.11 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  31.56 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  30.23 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  32.42 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.75 
 
 		 325 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  29.72 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30 
 
 		 319 aa  90.1  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.75 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1504  hypothetical protein  26.29 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.890142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  27.91 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  24.68 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  26.89 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  22.34 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  30.83 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2680  SCP-like extracellular  26.49 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  37.61 
 
 		 458 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  27.69 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.7 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  32.85 
 
 		 180 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  30.25 
 
 		 500 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  29.86 
 
 		 214 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  28.7 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  28.69 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  24.62 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0130  hypothetical protein  34.21 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2195  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.7 
 
 		 232 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0225446  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  22.64 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>