19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3673 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 325 aa  672    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  98.15 
 
 		 325 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  87.38 
 
 		 310 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  64.94 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.71 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.64 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  28.83 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  27.46 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  27.18 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  26.83 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  26.86 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  26.86 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  28.62 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  29.6 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  26.13 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  31.51 
 
 		 466 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1504  hypothetical protein  26.65 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.890142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  29.75 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  35.05 
 
 		 459 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>