21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5562 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  100 
 
 
340 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  66.87 
 
 
337 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  59.86 
 
 
341 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  60.21 
 
 
341 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  48.98 
 
 
327 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  48.98 
 
 
327 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.94 
 
 
352 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  32.76 
 
 
352 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.85 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  29.6 
 
 
382 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  25.23 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  28.48 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.18 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.13 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.13 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  28.98 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1504  hypothetical protein  24.74 
 
 
396 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.890142  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  26.4 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  22.89 
 
 
456 aa  50.4  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  24.19 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  31.37 
 
 
176 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>