23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4336 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 352 aa  709    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  49.12 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  51.15 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  33 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  33 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  33.1 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  31.16 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  30.27 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  29.93 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.93 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.23 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  31.95 
 
 		 310 aa  93.2  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1504  hypothetical protein  29.18 
 
 		 396 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.890142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.7 
 
 		 319 aa  92.8  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  27.24 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  27.94 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  26.57 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  30.73 
 
 		 456 aa  53.9  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  26.64 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  33.03 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  29.77 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.67 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  29.61 
 
 		 197 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>